RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220429.12

GABPB1-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1, Length 2,726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-201ENST00000220429 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.68□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.68□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 DUSP10Q9Y6W6 482 aa14.68□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 RHOBTB3O94955 611 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 GNA14O95837 355 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 HSD17B3P37058 310 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 ADCY7P51828 1080 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 LSAMPQ13449 338 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 PODNQ7Z5L7 613 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 CCNJLQ8IV13 435 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 HIC2Q96JB3 615 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 VPS16Q9H269 839 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 CUEDC2Q9H467 287 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 DNAJC18Q9H819 358 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 EHD2Q9NZN4 543 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 KCNJ18B7U540 433 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 HLA-DOAP06340 250 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 CACNA2D1P54289 1103 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 SPAG1Q07617 926 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 BNIP1Q12981 228 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 KCNJ12Q14500 433 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 PLS1Q14651 629 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 MDM1Q8TC05 714 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 STK32AQ8WU08 396 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 MTMR9Q96QG7 549 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 TSKSQ9UJT2 592 aa14.67□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 CACNB3P54284 484 aa14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 TPBGLP0DKB5 382 aa14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 IDO1P14902 403 aa14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 CXCR5P32302 372 aa14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 C16orf87Q6PH81 154 aa14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 ASRGL1Q7L266 308 aa14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 WDR60Q8WVS4 1066 aa14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 TRIM9Q9C026 710 aa14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.66□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 H7C1D1 291 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 SLC37A4O43826 429 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 TDP2O95551 362 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 HOXD12P35452 270 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 SLC16A2P36021 539 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 TXKP42681 527 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 PSMD7P51665 324 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 MUM1Q2TAK8 710 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 OGFOD1Q8N543 542 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 PBKQ96KB5 322 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 HAPLN3Q96S86 360 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 PSMB7Q99436 277 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 GGT7Q9UJ14 662 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 FAM196BA6NMK8 535 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 KCNA3P22001 575 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 CA8P35219 290 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 MLH1P40692 756 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 KCTD1Q719H9 257 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 TRAIPQ9BWF2 469 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 PDP2Q9P2J9 529 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 LRCH1Q9Y2L9 728 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.65□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 TACC1O75410 805 aa14.65□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 BCRP11274 1271 aa14.65□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SULT2A1Q06520 285 aa14.65□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 TCP10Q12799 353 aa14.65□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CALCRLQ16602 461 aa14.65□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms