RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP4AP20648 1035 aa26.08■■□□□ 1.77
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RPUSD1-201ENST00000007264 SLC7A3Q8WY07 619 aa26.08■■□□□ 1.77
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RPUSD1-201ENST00000007264 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa26.08■■□□□ 1.77
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RPUSD1-201ENST00000007264 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
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