RNA–Protein interactions for RNA: YML116W

ATR1, Transcript of Multidrug efflux pump of the major facilitator superfamily, yeast

Gene ATR1, Length 1,629 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATR1	YML116W	HOT13	P36078	116 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	PRM9	P39551	298 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	FMC1	P40491	155 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	SSN8	P47821	323 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	RRN9	P53437	365 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	IES4	Q08561	116 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	SRL2	Q12020	392 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	COX2	P00410	251 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	RAD7	P06779	565 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	CDC23	P16522	626 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	VAM7	P32912	316 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	FRE2	P36033	711 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	SLM1	P40485	686 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	ABM1	P47146	123 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	KTR6	P54070	446 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	HXT11	P54862	567 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	RSN1	Q03516	953 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	LSB5	P25369	354 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	RIM2	P38127	377 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	FAA2	P39518	744 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	IRC7	P43623	340 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	BIO4	P53630	237 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	TIM8	P57744	87 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	IZH1	Q03419	316 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	BNA5	Q05979	453 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	PHO13	P19881	312 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	COX13	P32799	129 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	NUF2	P33895	451 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YKL071W	P36086	256 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	APD1	P38281	316 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	MMS21	P38632	267 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	VPS52	P39904	641 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YAR1	P46683	200 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	BET5	Q03630	159 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	GTO3	Q04806	366 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	SHS1	Q07657	551 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	THI20	Q08224	551 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	COQ3	P27680	312 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	POP5	P28005	173 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YGR210C	P42942	411 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YNL234W	P53857	426 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	SAM50	P53969	484 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YCR100C	P25606	316 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	PDR3	P33200	976 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	ECM15	P35195	104 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	SPC34	P36131	295 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YPK3	P38070	525 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	DTR1	P38125	572 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	MRX3	P38172	270 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	HIS2	P38635	335 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	BIG1	P38813	335 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	SHO1	P40073	367 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YER186C	P40101	306 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	AIM24	P47127	394 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	GAT3	Q07928	141 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	SIA1	Q12212	622 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	NCA2	Q12374	616 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YOP1	Q12402	180 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	JIP3	O13555	125 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YSR3	P23501	404 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	CYM1	P32898	989 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	IST2	P38250	946 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	RTS2	P40962	232 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	VPS25	P47142	202 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	KAP114	P53067	1004 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	ATP23	P53722	227 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66

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