RNA–Protein interactions for RNA: YLR169W

YLR169W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YLR169W, Length 354 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR169W	YLR169W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	TRM82	Q03774	444 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	ARR1	Q06596	294 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	SLM3	Q12093	417 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	FRE8	Q12209	686 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	URA10	P30402	227 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	SMI1	P32566	505 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	MRPS5	P33759	307 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	SIF2	P38262	535 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	EFM1	P38732	585 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	YIL089W	P40500	205 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	YHC3	P47040	408 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	NAS6	P50086	228 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	SUR7	P54003	302 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	RGS2	Q99188	309 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	STE3	P06783	470 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	YLL053C	P0CD98	152 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	CPT1	P17898	393 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.69	□□□□□ -1.98	not detected
YLR169W	YLR169W	PCH2	P38126	564 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	YHR122W	P38829	231 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	YMR134W	P40207	237 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	CUP2	P15315	225 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	SAG1	P20840	650 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	HXT2	P23585	541 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	MXR2	P25566	168 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	YEL043W	P32618	956 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	YKL071W	P36086	256 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	UIP5	P36137	443 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	IST2	P38250	946 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	TAE1	P38340	232 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	YMR262W	P38430	313 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	ATG7	P38862	630 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	YNL146W	P53906	100 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	SCS7	Q03529	384 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	GMC1	Q04399	608 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	NAT4	Q04751	285 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	YOR012W	Q12351	137 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	DAL5	P15365	543 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	UTR5	P32630	166 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	CSM3	Q04659	317 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	ALE1	Q08548	619 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	RPS23B	P0CX30	145 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	ERG9	P29704	444 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	MKK1	P32490	508 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	ALP1	P38971	573 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	YGL114W	P53134	725 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	NRM1	P53718	249 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	YDR018C	Q12185	396 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YLR169W	YLR169W	PPQ1	P32945	549 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	PEX32	P38292	413 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	YFR018C	P43599	363 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	UTR1	P21373	530 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	CIN8	P27895	1000 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	MYO3	P36006	1272 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	IML3	P38265	245 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	HIT1	P46973	164 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	ASG7	P46993	209 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	HCH1	P53834	153 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	REX3	Q12090	404 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	PSY3	Q12318	242 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	SPO24	Q3E752	67 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	VPS63	O13549	108 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	RAD1	P06777	1100 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	CTA1	P15202	515 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	RBK1	P25332	333 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	DCC1	P25559	380 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	TKL2	P33315	681 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	SDH4	P37298	181 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	GPI8	P49018	411 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	INP1	Q03694	420 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	MGR3	Q04472	501 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	SPH1	Q06160	661 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	ITR2	P30606	609 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	MMS21	P38632	267 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	ECM14	P38836	430 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	NAS2	P40555	220 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	YCH1	P42937	148 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	TAF6	P53040	516 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	BUR2	Q05949	395 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YLR169W	YLR169W	YDR262W	Q12331	272 aa		2.61	□□□□□ -1.99

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