RNA–Protein interactions for RNA: YKR041W

YKR041W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKR041W, Length 753 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR041W	YKR041W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	CDC23	P16522	626 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	ERD2	P18414	219 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	SNF6	P18888	332 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	RSC6	P25632	483 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	YIM1	P28625	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	ACB1	P31787	87 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	ATP11	P32453	318 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	GSH1	P32477	678 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	PXA2	P34230	853 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	SOL2	P37262	315 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	YRO2	P38079	344 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	ALG3	P38179	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	LEU5	P38702	357 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	GGC1	P38988	300 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	FMC1	P40491	155 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	AIM25	P47140	327 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	ROG1	P53118	685 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	SWC4	P53201	476 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	FRE4	P53746	719 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	DLT1	Q04216	342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	ELP6	Q04868	273 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	RNH202	Q05635	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	BSP1	Q06604	576 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	KIN3	P22209	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	HXT2	P23585	541 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	TRX3	P25372	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	YCR102C	P25608	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	DOA4	P32571	926 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	LST4	P34239	828 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	YKL097C	P34245	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	EMC3	P36039	253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	MNN2	P38069	597 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	SHE1	P38200	338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	IML3	P38265	245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	RTC2	P38279	296 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	ALP1	P38971	573 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	PKP1	P40530	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	APQ12	P40532	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	MAD2	P40958	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	MDE1	P47095	244 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	PMT5	P52867	743 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	YGL101W	P53144	215 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	VOA1	P53262	265 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	COS1	P53822	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	AAT1	Q01802	451 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	RRN11	Q04712	507 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	GIC2	Q06648	383 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	THI72	Q08579	599 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	BTS1	Q12051	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	PRM4	Q12498	284 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR041W	YKR041W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	UTR1	P21373	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YCK1	P23291	538 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	MKK1	P32490	508 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	SFA1	P32771	386 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	VPS17	P32913	551 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	SKN1	P33336	771 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	GMH1	P36125	273 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PAU24	P38155	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	MSS4	P38994	779 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YEL073C	P39974	107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	GIP2	P40036	548 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PFA3	P42836	336 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	JAC1	P53193	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YGR079W	P53249	370 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PAU12	P53343	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	TIM44	Q01852	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	MSS11	Q03825	758 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	DCR2	Q05924	578 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.8 ms