RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637243.1

CHRNA4-218, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 85 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-218ENST00000637243 PTPN14Q15678 1187 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 KIZQ2M2Z5 673 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 LETM2Q2VYF4 491 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ECHDC2Q86YB7 292 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 VPS52Q8N1B4 723 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ZBTB44Q8NCP5 570 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 PJA1Q8NG27 643 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 PIBF1Q8WXW3 757 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 GPRASP2Q96D09 838 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 OSMRQ99650 979 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 IL25Q9H293 177 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 GINS2Q9Y248 185 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ANHXE9PGG2 379 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 PIK3CDO00329 1044 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 STK25O00506 426 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ATG7O95352 703 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 PAPLNO95428 1278 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 C22orf31O95567 290 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 CCNE2O96020 404 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 VTNP04004 478 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 CTSAP10619 480 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 SRFP11831 508 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 FGFR4P22455 802 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 PPM1AP35813 382 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 TROAPQ12815 778 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 FZD5Q13467 585 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 PPM1JQ5JR12 505 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 MCTP1Q6DN14 999 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 IQCA1Q86XH1 822 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 LRRC43Q8N309 656 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 NME8Q8N427 588 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 HELQQ8TDG4 1101 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 RTKNQ9BST9 563 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 EPC1Q9H2F5 836 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 COL4A2P08572 1712 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 M0QZ92 97 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 KINO60870 393 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 RFPL2O75678 378 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 GALTP07902 379 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 MYBP10242 640 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 TDGF1P13385 188 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 STARD6P59095 220 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ACTR2P61160 394 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 KRT17Q04695 432 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 HTR4Q13639 388 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 PKP1Q13835 747 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ANKRD1Q15327 319 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 UBE2SQ16763 222 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF528Q3MIS6 628 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 RNF20Q5VTR2 975 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 POTEHQ6S545 545 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA4-218ENST00000637243 TSSK4Q6SA08 328 aa6.67□□□□□ -1.34
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