RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636773.1

CACNB4-233, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 4,143 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-233	ENST00000636773	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	WDR64	B1ANS9	1081 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773		K7ERI5	159 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	NEMF	O60524	1076 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	EXOC3	O60645	756 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ATIC	P31939	592 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	KRT76	Q01546	638 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CLUL1	Q15846	466 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PIGS	Q96S52	555 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	DYRK4	Q9NR20	520 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	IPP	Q9Y573	584 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	SPTLC1	O15269	473 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	RNF8	O76064	485 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	SLC10A3	P09131	477 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	NFKBIA	P25963	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	POLE2	P56282	527 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	BEX3	Q00994	111 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	IL31	Q6EBC2	164 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	SV2B	Q7L1I2	683 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	SPOCK2	Q92563	424 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	USP18	Q9UMW8	372 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	MEGF6	O75095	1541 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	BIN1	O00499	593 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CLTB	P09497	229 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	GHR	P10912	638 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ITGA4	P13612	1032 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	KRT10	P13645	584 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	FOSL1	P15407	271 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ADD2	P35612	726 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PRELP	P51888	382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ST8SIA6	P61647	398 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ITIH3	Q06033	890 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ZNF174	Q15697	407 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CABP7	Q86V35	215 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ACER1	Q8TDN7	264 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	FLT1	P17948	1338 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	GFPT2	O94808	682 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CYBB	P04839	570 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ACR	P10323	421 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	POSTN	Q15063	836 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ARMCX2	Q7L311	632 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	SNX19	Q92543	992 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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