RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636652.1

CHRNA4-216, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 195 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-216ENST00000636652 SMTNP53814 917 aa14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 NCKAP1LP55160 1127 aa14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 POU5F1BQ06416 359 aa14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 CAPSQ13938 189 aa14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ZNF410Q86VK4 478 aa14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 DEPTORQ8TB45 409 aa14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 KCNN1Q92952 543 aa14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 TOX2Q96NM4 488 aa14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 FIZ1Q96SL8 496 aa14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 SYCE3A1L190 88 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 CCDC169A6NNP5 214 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 BIN1O00499 593 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 CD4P01730 458 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 VTNP04004 478 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ABCD1P33897 745 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 GPC3P51654 580 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 STK4Q13043 487 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ALCAMQ13740 583 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 RNF149Q8NC42 400 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 NLRP4Q96MN2 994 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 UBE4BO95155 1302 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 K7ENM7 598 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 M0QZ92 97 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 PPP1R2P41236 205 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 PHKA2P46019 1235 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 EFNA5P52803 228 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 NLRP12P59046 1061 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 RBL2Q08999 1139 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 TRIM60Q495X7 471 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 KSR1Q8IVT5 923 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 CAGE1Q8TC20 777 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 WNT8BQ93098 351 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 HPS3Q969F9 1004 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 HVCN1Q96D96 273 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 SCLT1Q96NL6 688 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ADAMTS10Q9H324 1103 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 GDAQ9Y2T3 454 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 SLC16A4O15374 487 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 GPR32O75388 356 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 PPP1R37O75864 691 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 KIF20AO95235 890 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 GCNT3O95395 438 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 CCDC192P0DO97 292 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 BMP6P22004 513 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 THPOP40225 353 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 PTENP60484 403 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 GTF2BQ00403 316 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 TLE2Q04725 743 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 TYRO3Q06418 890 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 STX1AQ16623 288 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 MLKLQ8NB16 471 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 NLRP7Q8WX94 980 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 STRA6Q9BX79 667 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ANO10Q9NW15 660 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 DACH1Q9UI36 760 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms