RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635997.1

NEDD4L-238, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5 BASIC

Gene NEDD4L, Length 4,402 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-238	ENST00000635997	CDO1	Q16878	200 aa		15.44	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	RNF149	Q8NC42	400 aa		15.44	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	TRIM9	Q9C026	710 aa		15.44	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	CYP2C19	P33261	490 aa		15.44	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	STAT5B	P51692	787 aa		15.44	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	STK4	Q13043	487 aa		15.44	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	E2F4	Q16254	413 aa		15.44	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	GRIK5	Q16478	980 aa		15.44	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		15.44	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		15.44	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		15.44	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		15.44	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	BFSP1	Q12934	665 aa		15.44	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	HIP1R	O75146	1068 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	STAMBP	O95630	424 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PTPRA	P18433	802 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	URGCP	Q8TCY9	931 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZNF18	P17022	549 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCDC6	Q16204	474 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	MSRA	Q9UJ68	235 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ELN	P15502	786 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	SAT1	P21673	171 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PPFIA1	Q13136	1202 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	TUBB2A	Q13885	445 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	FZD9	O00144	591 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	AKR1A1	P14550	325 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	EBAG9	O00559	213 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ERVK-9	P63128	1117 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ERVK-24	P63145	666 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	TMEM270	Q6UE05	265 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCNY	Q8ND76	341 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PTGER2	P43116	358 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ADCY1	Q08828	1119 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	CLUL1	Q15846	466 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	MTR	Q99707	1265 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	CDC23	Q9UJX2	597 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	VEGFB	P49765	207 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ITIH3	Q06033	890 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	EPHA7	Q15375	998 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	GCNA	Q96QF7	691 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	TTC26	A0AVF1	554 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	LRRD1	A4D1F6	860 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	LRRC53	A6NM62	1247 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	DGKD	Q16760	1214 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	IER5	Q5VY09	327 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	YME1L1	Q96TA2	773 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	CLGN	O14967	610 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	MFAP3L	O75121	409 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ADORA2A	P29274	412 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ACOT2	P49753	483 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	TRIM7	Q9C029	511 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	YDJC	A8MPS7	323 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	DPYSL4	O14531	572 aa		15.4	■□□□□ 0.06

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