RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631166.1

HS1BP3-208, Transcript of HCLS1 binding protein 3, human

TSL 5 BASIC

Gene HS1BP3, Length 78 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HS1BP3-208	ENST00000631166	TENM2	Q9NT68	2774 aa		2.8	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	HIVEP2	P31629	2446 aa		2.8	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		2.8	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	NUP98	P52948	1817 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	ASTN1	O14525	1302 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	NCAN	O14594	1321 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	WDR64	B1ANS9	1081 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	PRSS44	E7EML9	344 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	KCNQ3	O43525	872 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	TNFSF14	O43557	240 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	SERPINF2	P08697	491 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	INHBB	P09529	407 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	ITGA3	P26006	1051 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	HOXD12	P35452	270 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	CAP2	P40123	477 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	KRT17	Q04695	432 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	MYO1E	Q12965	1108 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	CCIN	Q13939	588 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	GRIK4	Q16099	956 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	TBR1	Q16650	682 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	MIDN	Q504T8	468 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	FBLN7	Q53RD9	439 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	USP49	Q70CQ1	688 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	UBR7	Q8N806	425 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNF384	Q8TF68	577 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	FGF14	Q92915	247 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	TCTN2	Q96GX1	697 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	PNMA5	Q96PV4	448 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	AGAP2	Q99490	1192 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	FOXC2	Q99958	501 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166		Q9Y3F1	56 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	NOTCH4	Q99466	2003 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	HERC2	O95714	4834 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	SIPA1L1	O43166	1804 aa		2.79	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	LRP4	O75096	1905 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	CLUH	O75153	1309 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	TNFRSF10B	O14763	440 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	TBC1D12	O60347	775 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	KPNA6	O60684	536 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	SLC25A27	O95847	323 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	MYL3	P08590	195 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	KRT19	P08727	400 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	RSPH10B	P0C881	870 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	C7	P10643	843 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	EPCAM	P16422	314 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	HOXC13	P31276	330 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	CA8	P35219	290 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	KRT85	P78386	507 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	PLCB3	Q01970	1234 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	MORC3	Q14149	939 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	MBTPS1	Q14703	1052 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	VWA2	Q5GFL6	755 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	ATP2A3	Q93084	1043 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	PHKB	Q93100	1093 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HS1BP3-208	ENST00000631166	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		2.77	□□□□□ -1.97

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