RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631023.2

CLN3-240, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,586 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-240ENST00000631023 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 YME1L1Q96TA2 773 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 E9PMD0 336 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 POU5F1BQ06416 359 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 CHST12Q9NRB3 414 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 TCHHQ07283 1943 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 MGEA5O60502 916 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 STK38Q15208 465 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 DACT1Q9NYF0 836 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 FGFR4P22455 802 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 PTENP60484 403 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 GRIN1Q05586 938 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 GRB10Q13322 594 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 PKP1Q13835 747 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 DSC3Q14574 896 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 ATL3Q6DD88 541 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 PNMA5Q96PV4 448 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 CSRNP2Q9H175 543 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 GLRA2P23416 452 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 KIFAP3Q92845 792 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 PLIN2Q99541 437 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN3-240ENST00000631023 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 C9IYK1 514 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 TAP1Q03518 808 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 CAPSQ13938 189 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 KCNK18Q7Z418 384 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 CFAP45Q9UL16 551 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 LCHNA4D1U4 455 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 YEATS4O95619 227 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 TXLNAP40222 546 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 FAM189BP81408 668 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 PPP2R5AQ15172 486 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 IFT74Q96LB3 600 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 SPTLC2O15270 562 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 DGKIO75912 1065 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 ERLIN2O94905 339 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 GRIN2CQ14957 1233 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 TIPINQ9BVW5 301 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 LINC01553A4QN01 128 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 PPP6R2O75170 966 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 BRD1O95696 1058 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 PLA2G4BP0C869 781 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 EPSTI1Q96J88 318 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 GUCD1Q96NT3 240 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 CLIC6Q96NY7 704 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 KCND2Q9NZV8 630 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-240ENST00000631023 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms