RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078		A0A0U1RQF3	1178 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	HOXA2	O43364	376 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	PSMA5	P28066	241 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	SFN	P31947	248 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	RUFY3	Q7L099	469 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	BLID	Q8IZY5	108 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	NLRP4	Q96MN2	994 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	GBP3	Q9H0R5	595 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	LZTS1	Q9Y250	596 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	NID2	Q14112	1375 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	NPEPPS	P55786	919 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	INF2	Q27J81	1249 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	CEP89	Q96ST8	783 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	MYO10	Q9HD67	2058 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	EML1	O00423	815 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	CPLX1	O14810	134 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	SLC37A4	O43826	429 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	EOMES	O95936	686 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	PPM1A	P35813	382 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	PHKA2	P46019	1235 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	DNM2	P50570	870 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	LETM2	Q2VYF4	491 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078		Q4G0T1	1027 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	XKR3	Q5GH77	459 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	VPS52	Q8N1B4	723 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	FBXL16	Q8N461	479 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	POMK	Q9H5K3	350 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	DACT1	Q9NYF0	836 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	15.16	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	EVC	P57679	992 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	NPY5R	Q15761	445 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	PTPN21	Q16825	1174 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	ANO5	Q75V66	913 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	FBXL6	Q8N531	539 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	CASP10	Q92851	521 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM169	Q96HH4	297 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078		M0R2N6	131 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	REC8	O95072	547 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	DEXI	O95424	95 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	MYB	P10242	640 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	EPCAM	P16422	314 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	CES5A	Q6NT32	575 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM143	Q96AN5	459 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCF4-262	ENST00000628078	ASIC4	Q96FT7	647 aa		15.15	■□□□□ 0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms