RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 RAB34Q9BZG1 259 aa12.33□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa12.33□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa12.33□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 STK24Q9Y6E0 443 aa12.33□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 A0A087WZ62 844 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 ASAP2O43150 1006 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 DGAT1O75907 488 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 RB1P06400 928 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 MUTP22033 750 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 CTNNB1P35222 781 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 FAM189BP81408 668 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 NBR1Q14596 966 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 MICALL1Q8N3F8 863 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 C4orf32Q8N8J7 132 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 PPM1EQ8WY54 764 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 NLRP4Q96MN2 994 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 CHST12Q9NRB3 414 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM161AQ9NX61 479 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 DACT1Q9NYF0 836 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 EYSQ5T1H1 3165 aa12.32□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 C5orf67F2Z3F1 127 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 H3BNC9 293 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 ZBTB39O15060 712 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 HOXA2O43364 376 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 RPA1P27694 616 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 PRPHP41219 470 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 RARRES1P49788 294 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 PTGDRQ13258 359 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 PDIA5Q14554 519 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 PTPROQ16827 1216 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 FERMT3Q86UX7 667 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 CATSPER3Q86XQ3 398 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 KSR1Q8IVT5 923 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM143Q96AN5 459 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 MS4A3Q96HJ5 214 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 NACC1Q96RE7 527 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 PLVAPQ9BX97 442 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 KIAA1671Q9BY89 1806 aa12.31□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 MED24O75448 989 aa12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 LINC00271P0C7V0 271 aa12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 PDCP20941 246 aa12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 FGFR4P22455 802 aa12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 BMPR1AP36894 532 aa12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 PHKA2P46019 1235 aa12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 GPM6BQ13491 265 aa12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 TFDP1Q14186 410 aa12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 CATSPER4Q7RTX7 472 aa12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 IGSF22Q8N9C0 903 aa12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 PIGOQ8TEQ8 1089 aa12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 TRAIPQ9BWF2 469 aa12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 IFT122Q9HBG6 1241 aa12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 THEGQ9P2T0 379 aa12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 LRWD1Q9UFC0 647 aa12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 A0A0U1RQF3 1178 aa12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 USO1O60763 962 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 SKIP12755 728 aa12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 POU5F1BQ06416 359 aa12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 TIGD5Q53EQ6 642 aa12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 NAALADL2Q58DX5 795 aa12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 DTHD1Q6ZMT9 781 aa12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 BRAPQ7Z569 592 aa12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 ECHDC2Q86YB7 292 aa12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 RNF149Q8NC42 400 aa12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 MCPH1Q8NEM0 835 aa12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 RSPH1Q8WYR4 309 aa12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 P2RX5Q93086 422 aa12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM117Q9H0C3 514 aa12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 LMAN2LQ9H0V9 348 aa12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa12.29□□□□□ -0.44
UBXN8-209ENST00000620074 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms