RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	MTMR3	Q13615	1198 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	USP37	Q86T82	979 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	NT5C1B	Q96P26	610 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	THAP12	O43422	761 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	KRT15	P19012	456 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	VAMP7	P51809	220 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	STRN3	Q13033	797 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	SPP2	Q13103	211 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	SEZ6	Q53EL9	994 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	KAT5	Q92993	513 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	CNKSR1	Q969H4	720 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ACCS	Q96QU6	501 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	AZI2	Q9H6S1	392 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	PNMA2	Q9UL42	364 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	MYO1F	O00160	1098 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	MAGEA9	P43362	315 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	PICK1	Q9NRD5	415 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	RNF14	Q9UBS8	474 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	LSP1	P33241	339 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ADRA2B	P18089	450 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	HSD17B3	P37058	310 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ARSH	Q5FYA8	562 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	NUP85	Q9BW27	656 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	STK32B	Q9NY57	414 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ALS2	Q96Q42	1657 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	PIK3CA	P42336	1068 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	FIGN	Q5HY92	759 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	NEK9	Q8TD19	979 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	MYH6	P13533	1939 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	NFIB	O00712	420 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	MEIS2	O14770	477 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	HSPA1L	P34931	641 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	IGBP1	P78318	339 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	CBWD6	Q4V339	395 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	NLRP14	Q86W24	1093 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	WDR91	A4D1P6	747 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	CLDN3	O15551	220 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP1R37	O75864	691 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ACOT2	P49753	483 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	RFFL	Q8WZ73	363 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ALG6	Q9Y672	507 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		13.74	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms