RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593048.5

CIRBP-241, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene CIRBP, Length 650 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-241ENST00000593048 NEK4P51957 841 aa18.09■□□□□ 0.49
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CIRBP-241ENST00000593048 ZNF410Q86VK4 478 aa18.09■□□□□ 0.49
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CIRBP-241ENST00000593048 DYDC2Q96IM9 177 aa18.06■□□□□ 0.48
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CIRBP-241ENST00000593048 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
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CIRBP-241ENST00000593048 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-241ENST00000593048 PPME1Q9Y570 386 aa18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-241ENST00000593048 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-241ENST00000593048 KIAA1671Q9BY89 1806 aa18.05■□□□□ 0.48
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CIRBP-241ENST00000593048 SRGAP2BP0DMP2 458 aa18.05■□□□□ 0.48
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CIRBP-241ENST00000593048 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
CIRBP-241ENST00000593048 TMEM143Q96AN5 459 aa18.05■□□□□ 0.48
CIRBP-241ENST00000593048 MSLNLQ96KJ4 702 aa18.05■□□□□ 0.48
CIRBP-241ENST00000593048 TCF25Q9BQ70 676 aa18.05■□□□□ 0.48
CIRBP-241ENST00000593048 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa18.05■□□□□ 0.48
CIRBP-241ENST00000593048 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CIRBP-241ENST00000593048 RGL1Q9NZL6 768 aa18.05■□□□□ 0.48
CIRBP-241ENST00000593048 CLEC1BQ9P126 229 aa18.05■□□□□ 0.48
CIRBP-241ENST00000593048 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CIRBP-241ENST00000593048 PIEZO1Q92508 2521 aa18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-241ENST00000593048 C19orf67A6NJJ6 358 aa18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-241ENST00000593048 DCXO43602 365 aa18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-241ENST00000593048 EYA4O95677 639 aa18.04■□□□□ 0.48
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