RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 ERMNQ8TAM6 284 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 KAT2BQ92831 832 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFB118Q96PH6 123 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TNMDQ9H2S6 317 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TTLL8A6PVC2 850 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAMTS4O75173 837 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 EYA4O95677 639 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 GJB1P08034 283 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SLFN14P0C7P3 912 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 RARBP10826 455 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 INSRRP14616 1297 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP11B2P19099 503 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC12A3P55017 1021 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PRMT2P55345 433 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 GJA9P57773 515 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ASIC1P78348 528 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PTSQ03393 145 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGEF6Q15052 776 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 POSTNQ15063 836 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC41Q15345 812 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNA10Q16322 511 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC183Q5T5S1 534 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SV2BQ7L1I2 683 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP57L1Q8IYX8 460 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 IQUBQ8NA54 791 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PPTC7Q8NI37 304 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ITPKCQ96DU7 683 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP170P1Q96L14 293 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 REEP2Q9BRK0 252 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF208Q9H0X6 261 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SETD4Q9NVD3 440 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 USP20Q9Y2K6 914 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 GDAQ9Y2T3 454 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 EMSYQ7Z589 1322 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 A6NJR5 290 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 H3BRB1 525 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 KLRC4O43908 158 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ASGR1P07306 291 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 IDEP14735 1019 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 RARRES1P49788 294 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CLCN3P51790 818 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 DPYDQ12882 1025 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MAPK7Q13164 816 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 GIT2Q14161 759 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 DGKDQ16760 1214 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC01559Q495D7 138 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SFR1Q86XK3 245 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 KSR1Q8IVT5 923 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 C4orf19Q8IY42 314 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 DAW1Q8N136 415 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 RDM1Q8NG50 284 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 NEK9Q8TD19 979 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 BSNDQ8WZ55 320 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP6V0A1Q93050 837 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM143Q96AN5 459 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 NACC1Q96RE7 527 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM9Q9C026 710 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms