RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	GLRA2	P23416	452 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	ARL2	P36404	184 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	PHKA2	P46019	1235 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	KCNJ6	P48051	423 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	CAPS	Q13938	189 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	IKBKE	Q14164	716 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	ODR4	Q5SWX8	454 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	ADAL	Q6DHV7	355 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	KIFAP3	Q92845	792 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	APBB2	Q92870	758 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	IFT74	Q96LB3	600 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	PADI3	Q9ULW8	664 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	TCTN1	Q2MV58	587 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	SV2B	Q7L1I2	683 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	FAM228A	Q86W67	206 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	DRC1	Q96MC2	740 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GVL5	298 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	GPR182	O15218	404 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	27.61	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	HERVK_113	Q902F9	699 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	KCND2	Q9NZV8	630 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	BAIAP3	O94812	1187 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	PFKFB1	P16118	471 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	PPP2R5A	Q15172	486 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	FSIP1	Q8NA03	581 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	IQUB	Q8NA54	791 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	PRO3102	Q9H379	93 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	CMA1	P23946	247 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	GUCY2C	P25092	1073 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	BSND	Q8WZ55	320 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	REEP2	Q9BRK0	252 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC169	A6NNP5	214 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	SFI1	A8K8P3	1242 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	LIG1	P18858	919 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	PEX3	P56589	373 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	DYM	Q7RTS9	669 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	STAM	Q92783	540 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	DENND3	A2RUS2	1198 aa		27.57	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	EFCAB14	O75071	495 aa		27.57	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	ERLIN2	O94905	339 aa		27.57	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	FAM13A	O94988	1023 aa		27.57	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	ARSH	Q5FYA8	562 aa		27.57	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		27.57	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		27.57	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	CUEDC2	Q9H467	287 aa		27.57	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	NAMPT	P43490	491 aa		27.56	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	PTEN	P60484	403 aa		27.56	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	E2F4	Q16254	413 aa		27.56	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		27.56	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	DAW1	Q8N136	415 aa		27.56	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		27.56	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		27.56	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1W2PPC1	479 aa		27.55	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1W2PQ27	194 aa		27.55	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1W2PQ64	194 aa		27.55	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1W2PQD8	194 aa		27.55	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	AMH	P03971	560 aa		27.55	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	SYK	P43405	635 aa		27.55	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	DEFB103A	P81534	67 aa		27.55	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	MAPK7	Q13164	816 aa		27.55	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	27.55	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		27.55	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		27.55	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	MYMK	A6NI61	221 aa		27.54	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFA8	P51970	172 aa		27.54	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		27.54	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		27.54	■■■□□ 2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms