RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 TBX4P57082 545 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 IRF9Q00978 393 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 MYLIPQ8WY64 445 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 TNKSO95271 1327 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PALLDQ8WX93 1383 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 K7ESF4 209 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 MAN2B1O00754 1011 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 RFC4P35249 363 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 LRP8Q14114 963 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 CDH19Q9H159 772 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 GPR160Q9UJ42 338 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 COL18A1P39060 1754 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1W2PQJ5 194 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 GLTPD2A6NH11 291 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 KRIT1O00522 736 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 KCNK3O14649 394 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 SRGAP3O43295 1099 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 MT-CO1P00395 513 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 LSP1P33241 339 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 GALK1P51570 392 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 BROXQ5VW32 411 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 NETO2Q8NC67 525 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 VTA1Q9NP79 307 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 TOMM22Q9NS69 142 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 RNF181Q9P0P0 153 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 DSEQ9UL01 958 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 RTL1A6NKG5 1358 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 KIF24Q5T7B8 1368 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 A0A0G2JLW4 131 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 DVL2O14641 736 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 TGM5O43548 720 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 MAFKO60675 156 aa6.9□□□□□ -1.3
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PTPRM-208ENST00000578600 SLC9A1P19634 815 aa6.9□□□□□ -1.3
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PTPRM-208ENST00000578600 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 EPHA5P54756 1037 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 ERVFRD-1P60508 538 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 ERVK-21P61565 698 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 STEAP3Q658P3 488 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 BICRALQ6AI39 1079 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 NME9Q86XW9 330 aa6.9□□□□□ -1.3
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PTPRM-208ENST00000578600 SEC14L1Q92503 715 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 DLG3Q92796 817 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
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PTPRM-208ENST00000578600 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PXDNLA1KZ92 1463 aa6.9□□□□□ -1.31
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PTPRM-208ENST00000578600 NFAT5O94916 1531 aa6.9□□□□□ -1.31
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PTPRM-208ENST00000578600 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 SCDO00767 359 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 SGSM2O43147 1006 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 CAND2O75155 1236 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 DPEP1P16444 411 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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