RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 KRT13P13646 458 aa25.22■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 EPHB4P54760 987 aa25.22■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 TMEM174Q8WUU8 243 aa25.22■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.22■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 SYT11Q9BT88 431 aa25.22■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 PCIF1Q9H4Z3 704 aa25.22■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 KCNK3O14649 394 aa25.21■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 RNF40O75150 1001 aa25.21■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 LMNB1P20700 586 aa25.21■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 RNF207Q6ZRF8 634 aa25.21■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 C12orf56Q8IXR9 622 aa25.21■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 USP38Q8NB14 1042 aa25.21■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 RMDN3Q96TC7 470 aa25.21■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.21■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 PXMP2Q9NR77 195 aa25.21■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 CCDC66A2RUB6 948 aa25.2■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 TMEM150BA6NC51 233 aa25.2■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 NFKBIEO00221 500 aa25.2■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 BACH1O14867 736 aa25.2■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 ATP9AO75110 1047 aa25.2■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 LMAN1P49257 510 aa25.2■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 C4orf19Q8IY42 314 aa25.2■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 LMO3Q8TAP4 145 aa25.2■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 PBKQ96KB5 322 aa25.2■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25.2■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 PNMA2Q9UL42 364 aa25.2■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 GGCXP38435 758 aa25.2■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 GALCP54803 685 aa25.2■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 DLG4P78352 724 aa25.2■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 SLFN11Q7Z7L1 901 aa25.2■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 GLYCTKQ8IVS8 523 aa25.2■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 CBWD1Q9BRT8 395 aa25.2■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 GDF3Q9NR23 364 aa25.2■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 EMSYQ7Z589 1322 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 AGPSO00116 658 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 CCNE2O96020 404 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 GLI1P08151 1106 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 JAK3P52333 1124 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 NPEPPSP55786 919 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 GTF2BQ00403 316 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 EMBQ6PCB8 327 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 HAUS6Q7Z4H7 955 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 FMNL3Q8IVF7 1028 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 LMBR1Q8WVP7 490 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 KRT12Q99456 494 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 TIPINQ9BVW5 301 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 TMEM59LQ9UK28 342 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 NCANO14594 1321 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 VWA5AO00534 786 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 RFX1P22670 979 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 VAMP7P51809 220 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 PSMC5P62195 406 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 NSMFQ6X4W1 530 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 IFT20Q8IY31 132 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 MICALL2Q8IY33 904 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 CAVIN3Q969G5 261 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 ATG4CQ96DT6 458 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 WNK4Q96J92 1243 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 HACL1Q9UJ83 578 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa25.19■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 CCDC172P0C7W6 258 aa25.18■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 ARHGAP44Q17R89 818 aa25.18■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.18■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 FAM204AQ9H8W3 233 aa25.18■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 GPRC5CQ9NQ84 441 aa25.18■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 HSPBP1Q9NZL4 362 aa25.18■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 GOLGA6BA6NDN3 693 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 WDR64B1ANS9 1081 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 FDX1P10109 184 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 SFNP31947 248 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 TNNC1P63316 161 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 KIF22Q14807 665 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 PTPROQ16827 1216 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 RLFQ13129 1914 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 WDR81Q562E7 1941 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 SLC16A4O15374 487 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 NCKAP1LP55160 1127 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 KRT76Q01546 638 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 PPP3CAQ08209 521 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 C1orf220Q5T0J3 134 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 PEX26Q7Z412 305 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 SYCE1Q8N0S2 351 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 XXYLT1Q8NBI6 393 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa25.17■■□□□ 1.62
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