RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTK2Q05397 1052 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 CABS1Q96KC9 395 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPAG5Q96R06 1193 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 EML1O00423 815 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 VGLL4Q14135 290 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 EPHA7Q15375 998 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 WHAMMQ8TF30 809 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 ELP3Q9H9T3 547 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIAA0754O94854 1291 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 GCNT3O95395 438 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 LSP1P33241 339 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A1W2PRG0 241 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF233A6NK53 670 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 AOC2O75106 756 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDCLQ13371 301 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 CFAP58Q5T655 872 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 RGL1Q9NZL6 768 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 CES2O00748 559 aa22.08■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP1R37O75864 691 aa22.08■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 GAP43P17677 238 aa22.08■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRKCIP41743 596 aa22.08■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 DNA2P51530 1060 aa22.08■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTGISQ16647 500 aa22.08■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.08■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.08■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.08■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.08■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 CASP4P49662 377 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 NAA35Q5VZE5 725 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 FBXW10Q5XX13 1052 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC35C1Q96A29 364 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZIC5Q96T25 663 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 SIX2Q9NPC8 291 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAP3K10Q02779 954 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 POLD4Q9HCU8 107 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 CSADQ9Y600 493 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 GLI1P08151 1106 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC10A3P09131 477 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNA1Q09470 495 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 WDR18Q9BV38 432 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 NAGPAQ9UK23 515 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP8B3O60423 1300 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLIC2O15247 247 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 TBC1D12O60347 775 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 NR1D1P20393 614 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANXA13P27216 316 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 STAT2P52630 851 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 SMTNP53814 917 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 JAM2P57087 298 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 C6orf89Q6UWU4 347 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 CAPN7Q9Y6W3 813 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYH11P35749 1972 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 TGFB1I1O43294 461 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM13AO94988 1023 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 MDH1P40925 334 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 ECE1P42892 770 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 MNAT1P51948 309 aa22.05■■□□□ 1.12
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