RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	TAP1	Q03518	808 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PAK1	Q13153	545 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPK7	Q13164	816 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	SERINC3	Q13530	473 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	MTERF2	Q49AM1	385 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	FIGN	Q5HY92	759 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	KANK2	Q63ZY3	851 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	SPC25	Q9HBM1	224 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	IFT57	Q9NWB7	429 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJC6	O75061	913 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	ONECUT2	O95948	504 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	NR4A1	P22736	598 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	AOAH	P28039	575 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	RABGGTB	P53611	331 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	JAM2	P57087	298 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	GABRE	P78334	506 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	RASA3	Q14644	834 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	OSTM1	Q86WC4	334 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXW5	Q969U6	566 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	BTBD7	Q9P203	1132 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	MPIG6B	O95866	241 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	ST5	P78524	1137 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	CD83	Q01151	205 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	GUCY1A3	Q02108	690 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC23A	Q15436	765 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	TM4SF20	Q53R12	229 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	LPP	Q93052	612 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC6	Q99741	560 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC66	A2RUB6	948 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNK3	O14649	394 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	CRTAM	O95727	393 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT15	P19012	456 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	MC4R	P32245	332 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	ADCY7	P51828	1080 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	MOGS	Q13724	837 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	JMY	Q8N9B5	988 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	NELL1	Q92832	810 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	AMN	Q9BXJ7	453 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	VWA7	Q9Y334	891 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	NAT1	P18440	290 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	ECE1	P42892	770 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	STAT5B	P51692	787 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	HERVK_113	P62684	666 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		3.74	□□□□□ -1.81

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