RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	15.64	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	15.64	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	TMX3	Q96JJ7	454 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	ZNF558	Q96NG5	402 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	SPTBN2	O15020	2390 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	STAM2	O75886	525 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	SP9	P0CG40	484 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	GLUL	P15104	373 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	FAM189B	P81408	668 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	DSC3	Q14574	896 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	LONRF3	Q496Y0	759 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	NLRX1	Q86UT6	975 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	BARHL2	Q9NY43	387 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	SPG21	Q9NZD8	308 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	15.62	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	DEXI	O95424	95 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	VTN	P04004	478 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	15.62	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	STK36	Q9NRP7	1315 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		15.61	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	DTNB	O60941	627 aa		15.61	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	FGFR4	P22455	802 aa		15.61	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	KRT17	Q04695	432 aa		15.61	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	ST3GAL2	Q16842	350 aa		15.61	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		15.61	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	15.61	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	VPS52	Q8N1B4	723 aa		15.61	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		15.61	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	RUBCN	Q92622	972 aa		15.61	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	SNX21	Q969T3	373 aa		15.61	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	PGBD1	Q96JS3	809 aa		15.61	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	15.61	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	FOXQ1	Q9C009	403 aa		15.61	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		15.61	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	15.61	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	FSD2	A1L4K1	749 aa		15.6	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	JAK2	O60674	1132 aa		15.6	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	NAPA	P54920	295 aa		15.6	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	ACTR2	P61160	394 aa		15.6	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	MTMR1	Q13613	665 aa		15.6	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		15.6	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		15.6	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	GPRASP2	Q96D09	838 aa		15.6	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		15.6	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		15.6	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		15.6	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	UST	Q9Y2C2	406 aa		15.6	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	ACACB	O00763	2458 aa		15.59	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		15.59	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		15.59	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	B4GALT3	O60512	393 aa		15.59	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	15.59	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	STAT5B	P51692	787 aa		15.59	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	BCAR1	P56945	870 aa		15.59	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		15.59	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	GPR152	Q8TDT2	470 aa		15.59	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	ZBP1	Q9H171	429 aa		15.59	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	AZI2	Q9H6S1	392 aa		15.59	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		15.59	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		15.59	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	ESYT2	A0FGR8	921 aa		15.58	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	PIK3CD	O00329	1044 aa		15.58	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	GPR32	O75388	356 aa		15.58	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	CCNE2	O96020	404 aa		15.58	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	15.58	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	ATP4A	P20648	1035 aa		15.58	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	CUL4A	Q13619	759 aa		15.58	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	GPR149	Q86SP6	731 aa		15.58	■□□□□ 0.08

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