RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551430.6

CS-226, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-226ENST00000551430 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CS-226ENST00000551430 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-226ENST00000551430 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-226ENST00000551430 MTRQ99707 1265 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-226ENST00000551430 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-226ENST00000551430 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-226ENST00000551430 ARID2Q68CP9 1835 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 RPA1P27694 616 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 GPM6BQ13491 265 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.25■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 DGAT1O75907 488 aa23.25■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 ARL2P36404 184 aa23.25■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.25■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 RNF149Q8NC42 400 aa23.25■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 TCP11Q8WWU5 503 aa23.25■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 A0A0U1RQF3 1178 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 PP2D1A8MPX8 630 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 GRM6O15303 877 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 ERMNQ8TAM6 284 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 CASD1Q96PB1 797 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 GPRC5CQ9NQ84 441 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 THEGQ9P2T0 379 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 RB1P06400 928 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 GLRA2P23416 452 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 CAPSQ13938 189 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 NACC1Q96RE7 527 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 CHST12Q9NRB3 414 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 MUC3AQ02505 3323 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 LAD1O00515 517 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 ASAP2O43150 1006 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 CDC25AP30304 524 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 PRPHP41219 470 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 PTENP60484 403 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 TFF2Q03403 129 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 PDIA5Q14554 519 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 LRRC55Q6ZSA7 311 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 RNF169Q8NCN4 708 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 ITGB1P05556 798 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 PHKA2P46019 1235 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 CAMK1Q14012 370 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 PLVAPQ9BX97 442 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 CWH43Q9H720 699 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 DACT1Q9NYF0 836 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-226ENST00000551430 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CS-226ENST00000551430 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.2■■□□□ 1.3
CS-226ENST00000551430 DNAJB1P25685 340 aa23.2■■□□□ 1.3
CS-226ENST00000551430 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CS-226ENST00000551430 PADI6Q6TGC4 694 aa23.2■■□□□ 1.3
CS-226ENST00000551430 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CS-226ENST00000551430 KLHL23Q8NBE8 558 aa23.2■■□□□ 1.3
CS-226ENST00000551430 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.2■■□□□ 1.3
CS-226ENST00000551430 LPPQ93052 612 aa23.2■■□□□ 1.3
CS-226ENST00000551430 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CS-226ENST00000551430 KIAA1671Q9BY89 1806 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-226ENST00000551430 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CS-226ENST00000551430 MUTP22033 750 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-226ENST00000551430 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-226ENST00000551430 AMHR2Q16671 573 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-226ENST00000551430 PTPROQ16827 1216 aa23.19■■□□□ 1.3
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