RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551206.5

USP15-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 1,022 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-217ENST00000551206 TCP11Q8WWU5 503 aa14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 NACC1Q96RE7 527 aa14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 MTRQ99707 1265 aa14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 PP2D1A8MPX8 630 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 C9IYK1 514 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 LAD1O00515 517 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 DGAT1O75907 488 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 PDCP20941 246 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 CDC25AP30304 524 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 PDIA5Q14554 519 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 ECM1Q16610 540 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 EPC2Q52LR7 807 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 ZNF410Q86VK4 478 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 TMEM192Q8IY95 271 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 RNF149Q8NC42 400 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 RNF169Q8NCN4 708 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 RAB34Q9BZG1 259 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 CHD7Q9P2D1 2997 aa14.52□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 TTC3P53804 2025 aa14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 ASAP2O43150 1006 aa14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 LPXNO60711 386 aa14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 FGFR1P11362 822 aa14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 SYT1P21579 422 aa14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 FAM189BP81408 668 aa14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 SNX21Q969T3 373 aa14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.51□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 CTNNB1P35222 781 aa14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 PRPHP41219 470 aa14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 KRT79Q5XKE5 535 aa14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 PADI6Q6TGC4 694 aa14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 HSCBQ8IWL3 235 aa14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 POLD4Q9HCU8 107 aa14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 ARL2P36404 184 aa14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 BMPR1AP36894 532 aa14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 GPM6BQ13491 265 aa14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 TFDP1Q14186 410 aa14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 LONRF3Q496Y0 759 aa14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 BRAPQ7Z569 592 aa14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 SAMD11Q96NU1 681 aa14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 PLIN2Q99541 437 aa14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 CHST12Q9NRB3 414 aa14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 DACT1Q9NYF0 836 aa14.49□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 A0A0U1RQF3 1178 aa14.48□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.48□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 GLRA2P23416 452 aa14.48□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 PHKA2P46019 1235 aa14.48□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.48□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.48□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 DNM3Q9UQ16 869 aa14.48□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 STK24Q9Y6E0 443 aa14.48□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP15-217ENST00000551206 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms