RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550718.1

GNPTAB-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-208ENST00000550718 A0A0A6YYJ9 748 aa7.22□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 MTSS1O43312 755 aa7.22□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 MYBPC3Q14896 1274 aa7.22□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa7.22□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.22□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 MFSD5Q6N075 450 aa7.22□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 GAREM2Q75VX8 874 aa7.22□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 IL23AQ9NPF7 189 aa7.22□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 DAPK3O43293 454 aa7.21□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 JMJD7P0C870 316 aa7.21□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 SDSP20132 328 aa7.21□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 INHBCP55103 352 aa7.21□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 CRHR2Q13324 411 aa7.21□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 MAN2A1Q16706 1144 aa7.21□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 CFAP100Q494V2 611 aa7.21□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 HTR3DQ70Z44 454 aa7.21□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 C7orf31Q8N865 590 aa7.21□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 CHFRQ96EP1 664 aa7.21□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 TCF25Q9BQ70 676 aa7.21□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.2□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 TOX4O94842 621 aa7.2□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 ADH4P08319 380 aa7.2□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 STAT3P40763 770 aa7.2□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 ADCY2Q08462 1091 aa7.2□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 CRB2Q5IJ48 1285 aa7.2□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.2□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 UBE2QL1A1L167 161 aa7.19□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 OVOL3O00110 214 aa7.19□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 SLC9A1P19634 815 aa7.19□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 KIR2DL3P43628 341 aa7.19□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 MAN2A2P49641 1150 aa7.19□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 LRRC32Q14392 662 aa7.19□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7.19□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 CEP89Q96ST8 783 aa7.19□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 PRRX2Q99811 253 aa7.19□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.19□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 OXSMQ9NWU1 459 aa7.19□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 ASMTLO95671 621 aa7.18□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 SCNN1GP51170 649 aa7.18□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 TCEA2Q15560 299 aa7.18□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.18□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 EFHBQ8N7U6 833 aa7.18□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.18□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 UBXN4Q92575 508 aa7.18□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 MTG2Q9H4K7 406 aa7.18□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.18□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 KANSL2Q9H9L4 492 aa7.18□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.18□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.18□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 OPHN1O60890 802 aa7.17□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 FSBPO95073 299 aa7.17□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 F2P00734 622 aa7.17□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 ACAP1Q15027 740 aa7.17□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 Q6ZRM9 215 aa7.17□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.17□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.17□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 DNAI1Q9UI46 699 aa7.17□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 XDHP47989 1333 aa7.17□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 MFAP3LO75121 409 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 IPO13O94829 963 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 CD40P25942 277 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 RABGGTBP53611 331 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 INHBEP58166 350 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 DSG1Q02413 1049 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 SPIDRQ14159 915 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 GPR158Q5T848 1215 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 KRT40Q6A162 431 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 MDGA1Q8NFP4 955 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 DRC1Q96MC2 740 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 HIST1H2AJQ99878 128 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 IKZF4Q9H2S9 585 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 ZMAT4Q9H898 229 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 IFT57Q9NWB7 429 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-208ENST00000550718 GAS7O60861 476 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms