RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550150.1

SMARCC2-208, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin subfamily c member 2, human

TSL 2

Gene SMARCC2, Length 3,244 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCC2-208	ENST00000550150	VPS41	P49754	854 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55	2e-6	■□□□□ 10.3
SMARCC2-208	ENST00000550150	CYP2J2	P51589	502 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	PSMD2	Q13200	908 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	FAM228A	Q86W67	206 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	GDAP1	Q8TB36	358 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	NFS1	Q9Y697	457 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	AKAP3	O75969	853 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	STAT1	P42224	750 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	CRK	P46108	304 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	SCFD2	Q8WU76	684 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	HAS1	Q92839	578 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	C18orf8	Q96DM3	657 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	GAN	Q9H2C0	597 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	SWAP70	Q9UH65	585 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	MED24	O75448	989 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	ACSL3	O95573	720 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	TRIM49	P0CI25	452 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	TRIM49C	P0CI26	452 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	CUL5	Q93034	780 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	TATDN2	Q93075	761 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	DNAJC18	Q9H819	358 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	NOD2	Q9HC29	1040 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	TBK1	Q9UHD2	729 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	EVI5	O60447	810 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	GNA14	O95837	355 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	CYP11B2	P19099	503 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	KCNJ1	P48048	391 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	PMS2	P54278	862 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	HOOK3	Q86VS8	718 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	NEK9	Q8TD19	979 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	PIM2	Q9P1W9	311 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	MCM8	Q9UJA3	840 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	AKR1B1	P15121	316 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	TCP10	Q12799	353 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	CCDC188	H7C350	402 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55	7e-15	■■□□□ 14
SMARCC2-208	ENST00000550150	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	CEP63	Q96MT8	703 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	REEP2	Q9BRK0	252 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	RAB17	Q9H0T7	212 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	BRCA2	P51587	3418 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150		G3V3G9	751 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	UPP2	O95045	317 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	LDHC	P07864	332 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	DRD4	P21917	467 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	ZNF76	P36508	570 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	GSTO1	P78417	241 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	SNX1	Q13596	522 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	MESD	Q14696	234 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	LONRF1	Q17RB8	773 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	GML	Q99445	158 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	THAP2	Q9H0W7	228 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	USP40	Q9NVE5	1235 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	DONSON	Q9NYP3	566 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMARCC2-208	ENST00000550150	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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