RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547283.5

CS-207, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-207ENST00000547283 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CS-207ENST00000547283 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-207ENST00000547283 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-207ENST00000547283 MTRQ99707 1265 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-207ENST00000547283 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-207ENST00000547283 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-207ENST00000547283 ARID2Q68CP9 1835 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 RPA1P27694 616 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 GPM6BQ13491 265 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.25■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 DGAT1O75907 488 aa23.25■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 ARL2P36404 184 aa23.25■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.25■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 RNF149Q8NC42 400 aa23.25■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 TCP11Q8WWU5 503 aa23.25■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 A0A0U1RQF3 1178 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 PP2D1A8MPX8 630 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 GRM6O15303 877 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 ERMNQ8TAM6 284 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 CASD1Q96PB1 797 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 GPRC5CQ9NQ84 441 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 THEGQ9P2T0 379 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 RB1P06400 928 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 GLRA2P23416 452 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 CAPSQ13938 189 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 NACC1Q96RE7 527 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 CHST12Q9NRB3 414 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 MUC3AQ02505 3323 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 LAD1O00515 517 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 ASAP2O43150 1006 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 CDC25AP30304 524 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 PRPHP41219 470 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 PTENP60484 403 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 TFF2Q03403 129 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 PDIA5Q14554 519 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 LRRC55Q6ZSA7 311 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 RNF169Q8NCN4 708 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 ITGB1P05556 798 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 PHKA2P46019 1235 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 CAMK1Q14012 370 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 PLVAPQ9BX97 442 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 CWH43Q9H720 699 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 DACT1Q9NYF0 836 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-207ENST00000547283 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CS-207ENST00000547283 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.2■■□□□ 1.3
CS-207ENST00000547283 DNAJB1P25685 340 aa23.2■■□□□ 1.3
CS-207ENST00000547283 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CS-207ENST00000547283 PADI6Q6TGC4 694 aa23.2■■□□□ 1.3
CS-207ENST00000547283 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CS-207ENST00000547283 KLHL23Q8NBE8 558 aa23.2■■□□□ 1.3
CS-207ENST00000547283 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.2■■□□□ 1.3
CS-207ENST00000547283 LPPQ93052 612 aa23.2■■□□□ 1.3
CS-207ENST00000547283 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CS-207ENST00000547283 KIAA1671Q9BY89 1806 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-207ENST00000547283 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CS-207ENST00000547283 MUTP22033 750 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-207ENST00000547283 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-207ENST00000547283 AMHR2Q16671 573 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-207ENST00000547283 PTPROQ16827 1216 aa23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms