RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 NLRX1Q86UT6 975 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ERO1BQ86YB8 467 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TMTC1Q8IUR5 882 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MAB21L3Q8N8X9 362 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 RETREG2Q8NC44 543 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CHST13Q8NET6 341 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 GPRASP2Q96D09 838 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 NDST4Q9H3R1 872 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ELP3Q9H9T3 547 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PARVGQ9HBI0 331 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ODF2LQ9ULJ1 636 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CAPN11Q9UMQ6 739 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 UBE4BO95155 1302 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CCDC151A5D8V7 595 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 WDR64B1ANS9 1081 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CXCL11O14625 94 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CALUO43852 315 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ATP9AO75110 1047 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 STAM2O75886 525 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 LYPLA2O95372 231 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 GCNT3O95395 438 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SFNP31947 248 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 HOXD13P35453 343 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 QARSP47897 775 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 KLK7P49862 253 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 RAB27AP51159 221 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ZNF131P52739 623 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 KRT76Q01546 638 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 GPR162Q16538 588 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CCDC40Q4G0X9 1142 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 HSP90B2PQ58FF3 399 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 FIGNQ5HY92 759 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 RAD9BQ6WBX8 426 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MYCT1Q8N699 235 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CEP112Q8N8E3 955 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 RDM1Q8NG50 284 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 OR8K1Q8NGG5 319 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 FAM71BQ8TC56 605 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 IQCDQ96DY2 449 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CDHR1Q96JP9 859 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 FUT8Q9BYC5 575 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TTYH3Q9C0H2 523 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 DNAI1Q9UI46 699 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SAMM50Q9Y512 469 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 LCTP09848 1927 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SCN4AP35499 1836 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 A0A1W2PQJ5 194 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 GLTPD2A6NH11 291 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 RASSF10A6NK89 507 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SFI1A8K8P3 1242 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PDXKO00764 312 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CETN3O15182 167 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CCDC175P0C221 793 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 NR2F2P24468 414 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ERVK-24P63145 666 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TUBB4BP68371 445 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PPIL2Q13356 520 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ADAM9Q13443 819 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MTF1Q14872 753 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PLCB4Q15147 1175 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PADI6Q6TGC4 694 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 RIOX2Q8IUF8 465 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CCDC50Q8IVM0 306 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 C4orf19Q8IY42 314 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CLMNQ96JQ2 1002 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 DNAJC7Q99615 494 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SENP7Q9BQF6 1050 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms