RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 COG2Q14746 738 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 IER5Q5VY09 327 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 TTC23LQ6PF05 361 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 BARGINQ6ZT62 677 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 CRLF3Q8IUI8 442 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 CLGNO14967 610 aa6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 KCNJ6P48051 423 aa6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 DR1Q01658 176 aa6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 STILQ15468 1287 aa6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 SLC35F6Q8N357 371 aa6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 AFG1LQ8WV93 481 aa6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 HACL1Q9UJ83 578 aa6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF521Q96K83 1311 aa6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 STK25O00506 426 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ASAP2O43150 1006 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 CD58P19256 250 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 YAF2Q8IY57 180 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 FAF2Q96CS3 445 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 MAP3K14Q99558 947 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PARVAQ9NVD7 372 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 MYH2Q9UKX2 1941 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 F5H6K3 240 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 SNX2O60749 519 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 NR3C1P04150 777 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 HOXC6P09630 235 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 CPT1AP50416 773 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGDIAP52565 204 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 OSTNP61366 133 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 GNGT1P63211 74 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 KLRC3Q07444 240 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 TTC8Q8TAM2 541 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 CYP27B1O15528 508 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 IL18RAPO95256 599 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 CD4P01730 458 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.321e-6■■■□□ 16.3
PDE4D-226ENST00000546160 GPSM2P81274 684 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF827Q17R98 1081 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ZMYND12Q9H0C1 365 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 EPB41L5Q9HCM4 733 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 C1orf167Q5SNV9 1468 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ATP6V1E1P36543 226 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 CFAP36Q96G28 342 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 MAPK13O15264 365 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 SNX17Q15036 470 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 FSCBQ5H9T9 825 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 VSTM4Q8IW00 320 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 FOPNLQ96NB1 174 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 SLC9A2Q9UBY0 812 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 DCCP43146 1447 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 KPNA7A9QM74 516 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ATP5HO75947 161 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 APOEP02649 317 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 MX2P20592 715 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 GNA15P30679 374 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ARL4CP56559 192 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 SNX1Q13596 522 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PDIA5Q14554 519 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 GPD1LQ8N335 351 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 BANK1Q8NDB2 785 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 DCTN3O75935 186 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 KRT37O76014 449 aa6.82□□□□□ -1.32
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