RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 CCDC113Q9H0I3 377 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 STOML1Q9UBI4 398 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 HDAC9Q9UKV0 1011 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 STK24Q9Y6E0 443 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SLIT2O94813 1529 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SMCO2A6NFE2 343 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 TCEA3O75764 348 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 CAV1Q03135 178 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 CALCOCO2Q13137 446 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PLS1Q14651 629 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 HLFQ16534 295 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 FAM47AQ5JRC9 791 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 HYIQ5T013 277 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ZDHHC24Q6UX98 284 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 BICDL1Q6ZP65 573 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 BARGINQ6ZT62 677 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 DNAJC10Q8IXB1 793 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SYNE4Q8N205 404 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 TBCKQ8TEA7 893 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 TEKT4Q8WW24 435 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 CCDC77Q9BR77 488 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 TUBB6Q9BUF5 446 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 TRIM31Q9BZY9 425 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ETNK1Q9HBU6 452 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 RGL1Q9NZL6 768 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ASB3Q9Y575 518 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 RPTORQ8N122 1335 aa11.67□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 LAMB2P55268 1798 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 NUP98P52948 1817 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ADAMTS3O15072 1205 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 MAPK13O15264 365 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 GNAT1P11488 350 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SKIP12755 728 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 KRT13P13646 458 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 STX2P32856 288 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 MAN1A1P33908 653 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ABL2P42684 1182 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 IL9RQ01113 521 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 TFAP4Q01664 338 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 NR1H3Q13133 447 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 CUL3Q13618 768 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 TCEAL1Q15170 157 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 MTFR1Q15390 333 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SEL1L2Q5TEA6 688 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 C11orf63Q6NUN7 778 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 FBXO25Q8TCJ0 367 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 TRIM4Q9C037 500 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 GRHL1Q9NZI5 618 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SCOCQ9UIL1 159 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ASAP1Q9ULH1 1129 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 MROH7Q68CQ1 1323 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa11.66□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 TMEM120BA0PK00 339 aa11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 NMT2O60551 498 aa11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 RFX1P22670 979 aa11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PON1P27169 355 aa11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PEX5P50542 639 aa11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 RAD23BP54727 409 aa11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 JAM2P57087 298 aa11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PPATQ06203 517 aa11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 CHRNDQ07001 517 aa11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 EXOC3L1Q86VI1 746 aa11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 VSIG1Q86XK7 387 aa11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SPICE1Q8N0Z3 855 aa11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 DNAJC9Q8WXX5 260 aa11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ART4Q93070 314 aa11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PLVAPQ9BX97 442 aa11.65□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 KCTD10Q9H3F6 313 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms