RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537007.5

MRPL48-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L48, human

TSL 3

Gene MRPL48, Length 287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL48-208	ENST00000537007	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	CPA4	Q9UI42	421 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	3.58	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	PSME4	Q14997	1843 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	CACNA1H	O95180	2353 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007		F8W031	263 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	ECE2	O60344	883 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	PRAMEF1	O95521	474 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	STARD3NL	O95772	234 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	DBH	P09172	617 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	ALAD	P13716	330 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	RAG1	P15918	1043 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF76	P36508	570 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	FHL2	Q14192	279 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	GBF1	Q92538	1859 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	OPTN	Q96CV9	577 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	KIF2C	Q99661	725 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	CHST7	Q9NS84	486 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	AK5	Q9Y6K8	562 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	TRIO	O75962	3097 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	AK9	Q5TCS8	1911 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	MROH6	A6NGR9	719 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	RGS13	O14921	159 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	A1BG	P04217	495 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	COL6A1	P12109	1028 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	ATF2	P15336	505 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	PRR5	P85299	388 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	KIR3DS1	Q14943	382 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	C17orf99	Q6UX52	265 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	BAD	Q92934	168 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	RMDN1	Q96DB5	314 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	TINF2	Q9BSI4	451 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	INVS	Q9Y283	1065 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	SPTBN2	O15020	2390 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	ABCC4	O15439	1325 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	PRR23A	A6NEV1	266 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	LAMTOR5	O43504	91 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	DCX	O43602	365 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	ASGR2	P07307	311 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	FLT3LG	P49771	235 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	GTF2A2	P52657	109 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	CORO7	P57737	925 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	KLF10	Q13118	480 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	SLC9A5	Q14940	896 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF575	Q86XF7	245 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	SPATA32	Q96LK8	384 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	JMJD8	Q96S16	334 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	CAPN10	Q9HC96	672 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MRPL48-208	ENST00000537007	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84

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