RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PACS1-208ENST00000529677 PDILTQ8N807 584 aa18.73■□□□□ 0.59
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PACS1-208ENST00000529677 TIGD1Q96MW7 591 aa18.73■□□□□ 0.59
PACS1-208ENST00000529677 KATNAL1Q9BW62 490 aa18.73■□□□□ 0.59
PACS1-208ENST00000529677 DNM3Q9UQ16 869 aa18.73■□□□□ 0.59
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PACS1-208ENST00000529677 TRPC6Q9Y210 931 aa18.69■□□□□ 0.58
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PACS1-208ENST00000529677 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa18.68■□□□□ 0.58
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PACS1-208ENST00000529677 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
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PACS1-208ENST00000529677 XKR9Q5GH70 373 aa18.68■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 PLA2G4FQ68DD2 849 aa18.68■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 KANK3Q6NY19 840 aa18.68■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 CEP57L1Q8IYX8 460 aa18.68■□□□□ 0.58
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PACS1-208ENST00000529677 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa18.67■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 ARHGEF35A5YM69 484 aa18.67■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 RRN3P2A6NIE6 340 aa18.67■□□□□ 0.58
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PACS1-208ENST00000529677 MYL1P05976 194 aa18.67■□□□□ 0.58
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PACS1-208ENST00000529677 RFC5P40937 340 aa18.67■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 KCNJ6P48051 423 aa18.67■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 PPFIA1Q13136 1202 aa18.67■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 KLHL40Q2TBA0 621 aa18.67■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 FAM47CQ5HY64 1035 aa18.67■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 NFRKBQ6P4R8 1299 aa18.67■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 C1orf186Q6ZWK4 172 aa18.67■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 SV2BQ7L1I2 683 aa18.67■□□□□ 0.58
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