RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523334.1

HDAC2-215, Transcript of histone deacetylase 2, human

TSL 2

Gene HDAC2, Length 4,810 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC2-215	ENST00000523334	SPOP	O43791	374 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	RFX1	P22670	979 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	MARK3	P27448	753 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	EPHX2	P34913	555 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	MEA1	Q16626	185 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	HDX	Q7Z353	690 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	MMP19	Q99542	508 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	GINS2	Q9Y248	185 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	KCNK3	O14649	394 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ANXA13	P27216	316 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	TMOD1	P28289	359 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	MAP3K10	Q02779	954 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PPAT	Q06203	517 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	KCNA1	Q09470	495 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	TFDP1	Q14186	410 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	KRT39	Q6A163	491 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	RIPK3	Q9Y572	518 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ASB14	A6NK59	587 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ATP9A	O75110	1047 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	FTCD	O95954	541 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PDE6C	P51160	858 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	BPIFB4	P59827	614 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	HERVK_113	P62684	666 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	IGBP1	P78318	339 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	TTLL4	Q14679	1199 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	TAF3	Q5VWG9	929 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ZNF536	O15090	1300 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	GRIN3B	O60391	1043 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	LYPLA2	O95372	231 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PON1	P27169	355 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	CNGA1	P29973	690 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	CXCR5	P32302	372 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	SOX5	P35711	763 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	NPTX2	P47972	431 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	CLCN6	P51797	869 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	CDR1	P51861	262 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	CNTN2	Q02246	1040 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PTK2	Q05397	1052 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	EMC2	Q15006	297 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms