RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-222ENST00000514552 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 WNT10BO00744 389 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 EFEMP2O95967 443 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 PNLIPP16233 465 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 KCNAB2Q13303 367 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 DLK2Q6UY11 383 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 WDR63Q8IWG1 891 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 LILRB2Q8N423 598 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 DNAAF4Q8WXU2 420 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 MPHOSPH8Q99549 860 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 CDC6Q99741 560 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 IRS2Q9Y4H2 1338 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 A0A1W2PQ27 194 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 A0A1W2PQ64 194 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 A0A1W2PQC6 194 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 A0A1W2PQD8 194 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 NPHS1O60500 1241 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 PRKCAP17252 672 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 LTBRP36941 435 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 SREBF2Q12772 1141 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 C2orf27AQ580R0 203 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 NUP43Q8NFH3 380 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 DIO2Q92813 273 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 SLC6A17Q9H1V8 727 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 HDAC9Q9UKV0 1011 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 ECM29Q5VYK3 1845 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 C7orf72A4D263 438 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 ARL4AP40617 200 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 TM4SF4P48230 202 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 CYP4F8P98187 520 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 MVKQ03426 396 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 G2E3Q7L622 706 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 ARAP2Q8WZ64 1704 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 ARNTLO00327 626 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 IL1R1P14778 569 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 KCNJ4P48050 445 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 CHRNDQ07001 517 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 INF2Q27J81 1249 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 MBLAC2Q68D91 279 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 ARMC9Q7Z3E5 817 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF804AQ7Z570 1209 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC103Q8IW40 242 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 DHRS4Q9BTZ2 278 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 CENPFP49454 3210 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 IGSF3O75054 1194 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 INHBEP58166 350 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 KIR3DS1Q14943 382 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 FAM209AQ5JX71 171 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 BEND3Q5T5X7 828 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 USP53Q70EK8 1073 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 IRF2BP1Q8IU81 584 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 DCAF4Q8WV16 495 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 EXOC2Q96KP1 924 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 CD209Q9NNX6 404 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 SSC5DA1L4H1 1573 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 BRCA2P51587 3418 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 GRM8O00222 908 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 MYO1BO43795 1136 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 ALDH1L1O75891 902 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 SASH1O94885 1247 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 MSL3P1P0C860 447 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 KLRK1P26718 216 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 GALK1P51570 392 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 GTF2A2P52657 109 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 ERVFRD-1P60508 538 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 FOXO4P98177 505 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 DLGAP5Q15398 846 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-222ENST00000514552 NTRK3Q16288 839 aa8.47□□□□□ -1.05
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