RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 HIDE1A8MVS5 230 aa19■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 EML1O00423 815 aa19■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 DTNBO60941 627 aa19■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 MAFO75444 373 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 PPM1AP35813 382 aa19■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 PSMC5P62195 406 aa19■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 SCRN1Q12765 414 aa19■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 ANO5Q75V66 913 aa19■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 RHPN2Q8IUC4 686 aa19■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 PHF20Q9BVI0 1012 aa19■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 CHST12Q9NRB3 414 aa19■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 SPG21Q9NZD8 308 aa19■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 LOC730098B7Z3J9 87 aa18.99■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 CDKL5O76039 1030 aa18.99■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 KRT17Q04695 432 aa18.99■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 KCNC3Q14003 757 aa18.99■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 PLA2G4FQ68DD2 849 aa18.99■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa18.99■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 KSR1Q8IVT5 923 aa18.99■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 KCNMB3Q9NPA1 279 aa18.99■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 GJB4Q9NTQ9 266 aa18.99■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 VAV3Q9UKW4 847 aa18.99■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 TPCN1Q9ULQ1 816 aa18.99■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP18.98■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 PHKA2P46019 1235 aa18.98■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 PPP2R5CQ13362 524 aa18.98■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 LLGL2Q6P1M3 1020 aa18.98■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 HFE2Q6ZVN8 426 aa18.98■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 TMC7Q7Z402 723 aa18.98■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 NEK8Q86SG6 692 aa18.98■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 ZNF410Q86VK4 478 aa18.98■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 SLC39A11Q8N1S5 342 aa18.98■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 SUSD6Q92537 303 aa18.98■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa18.98■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 FAM20AQ96MK3 541 aa18.98■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 PFKFB2O60825 505 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 SRGAP2BP0DMP2 458 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 TECP42680 631 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 QARSP47897 775 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 NPEPPSP55786 919 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 LONRF3Q496Y0 759 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 PPP4R3AQ6IN85 833 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD54Q6NXT1 300 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 OXER1Q8TDS5 423 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 EDAQ92838 391 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 LPPQ93052 612 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 NLRP4Q96MN2 994 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 TRAIPQ9BWF2 469 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 APOL5Q9BWW9 433 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 S1PR5Q9H228 398 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 CYP26B1Q9NR63 512 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 STK36Q9NRP7 1315 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 XBP1P17861 261 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 BCAR1P56945 870 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 SYCE2Q6PIF2 218 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 FAM105AQ9NUU6 356 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
HERC3-211ENST00000513325 MEIS3P2A8K0S8 358 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP18.95■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 CTDNEP1O95476 244 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 P4HBP07237 508 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 SLC7A3Q8WY07 619 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 HAS1Q92839 578 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 CEP170P1Q96L14 293 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 IFT122Q9HBG6 1241 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 C2orf71A6NGG8 1288 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 MARCH6O60337 910 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 SKIP12755 728 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 CA8P35219 290 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 GLB1LQ6UWU2 654 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 POTEDQ86YR6 584 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 TMEM143Q96AN5 459 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-211ENST00000513325 TMEM169Q96HH4 297 aa18.94■□□□□ 0.62
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