RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBE3AQ05086 875 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCP11Q8WWU5 503 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RSPH1Q8WYR4 309 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CASD1Q96PB1 797 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BDP1A6H8Y1 2624 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WNT7AO00755 349 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SKIP12755 728 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FGFR4P22455 802 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP4A11Q02928 519 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CTC1Q2NKJ3 1217 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XKR9Q5GH70 373 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP2R3CQ969Q6 453 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CWH43Q9H720 699 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFT122Q9HBG6 1241 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKEF1Q9NU02 776 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LAG3P18627 525 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAJB1P25685 340 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GUCY1B3Q02153 619 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RABEP1Q15276 862 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KSR1Q8IVT5 923 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABI1Q8IZP0 508 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM184AQ8NB25 1140 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POF1BQ8WVV4 589 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NLRP4Q96MN2 994 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF19AQ9NV58 838 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBTB39O15060 712 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HYAL1Q12794 435 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EMC2Q15006 297 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC55Q6ZSA7 311 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM143Q96AN5 459 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GRXCR2A6NFK2 248 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ST18O60284 1047 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF623O75123 536 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DGAT1O75907 488 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FGF18O76093 207 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP2B1P20020 1258 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MCM7P33993 719 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHKA2P46019 1235 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAPPC10P48553 1259 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLCB3Q01970 1234 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POU5F1BQ06416 359 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FERMT3Q86UX7 667 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC43Q8N309 656 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTRQ99707 1265 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM60Q9H2L4 133 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLDND1Q9NY35 253 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LZTS1Q9Y250 596 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LTBRP36941 435 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAB27AP51159 221 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADAM15Q13444 863 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLLU1OSQ5K130 101 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NOSTRINQ8IVI9 506 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 THNSL1Q8IYQ7 743 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF169Q8NCN4 708 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TUFT1Q9NNX1 390 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM50BQ9Y247 325 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIAA1671Q9BY89 1806 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H3BQ06 376 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IRS1P35568 1242 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPM1AP35813 382 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RARRES1P49788 294 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF174Q15697 407 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNT2Q6UVM3 1135 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EP400NLQ6ZTU2 488 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF149Q8NC42 400 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TLR9Q9NR96 1032 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms