RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508867.5

POLK-211, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 2,464 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-211ENST00000508867 FRMPD4Q14CM0 1322 aa10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ECE2O60344 883 aa10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 INPP5BP32019 993 aa10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 PDE6BP35913 854 aa10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 PRELPP51888 382 aa10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ARHGAP44Q17R89 818 aa10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 TMC3Q7Z5M5 1100 aa10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 NLRP14Q86W24 1093 aa10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 CSRNP1Q96S65 589 aa10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 DPH5Q9H2P9 285 aa10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 SEL1LQ9UBV2 794 aa10.07□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 NCANO14594 1321 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 E7EVH7 732 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 GAS7O60861 476 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 FAM107AO95990 144 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ARP10275 920 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 TNFAIP3P21580 790 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 COPB2P35606 906 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 PPP2R5AQ15172 486 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 CEP55Q53EZ4 464 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 CCDC174Q6PII3 467 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 RUFY4Q6ZNE9 571 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 BANK1Q8NDB2 785 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 LMO3Q8TAP4 145 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ACER1Q8TDN7 264 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 HOOK2Q96ED9 719 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 NACC1Q96RE7 527 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 TRIM51Q9BSJ1 452 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 TRIM31Q9BZY9 425 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 COG5Q9UP83 839 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 DCDC2CA8MYV0 355 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 LRRN2O75325 713 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 POLR2MP0CAP2 368 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 TMOD1P28289 359 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 DLG4P78352 724 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 BFSP1Q12934 665 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 BIRC3Q13489 604 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 PAGR1Q9BTK6 254 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 UNC45AQ9H3U1 944 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ERVK-5Q9HDB9 667 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 FAM114A2Q9NRY5 505 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ODF2LQ9ULJ1 636 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 BCS1LQ9Y276 419 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ATRNL1Q5VV63 1379 aa10.06□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 AFF2P51816 1311 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ANKRD62A6NC57 917 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 EXOC3O60645 756 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ENTPD3O75355 529 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 CCDC172P0C7W6 258 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 PTENP60484 403 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 MYL7Q01449 175 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 MTMR3Q13615 1198 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ODF2Q5BJF6 829 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 FBXW10Q5XX13 1052 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 SYCP3Q8IZU3 236 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 DAW1Q8N136 415 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 OTUD6BQ8N6M0 293 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ATP8B4Q8TF62 1192 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ALG3Q92685 438 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 GLG1Q92896 1179 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ZNF577Q9BSK1 485 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 STRA6Q9BX79 667 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 CARD9Q9H257 536 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 UBE4BO95155 1302 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 MMP10P09238 476 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 VIL1P09327 827 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 MAPK7Q13164 816 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 KIF22Q14807 665 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 AADACL2Q6P093 401 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 LXNQ9BS40 222 aa10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP10.05□□□□□ -0.8
POLK-211ENST00000508867 KCND2Q9NZV8 630 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms