RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 USP7Q93009 1102 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 FERMT2Q96AC1 680 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 BORCS6Q96GS4 357 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 WDR92Q96MX6 357 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 ADOQ96SZ5 270 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 A0A0A6YYJ9 748 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 ANKRD62A6NC57 917 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.353e-7■■■□□ 16.8
PDE4D-215ENST00000506510 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 BPIFB4P59827 614 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 TCIRG1Q13488 830 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 RIN1Q13671 783 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 DDB1Q16531 1140 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 HS1BP3Q53T59 392 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 GPR158Q5T848 1215 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 LPPQ93052 612 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-215ENST00000506510 KDM1AO60341 852 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 BPIP17213 487 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 ID4P47928 161 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 ADCY7P51828 1080 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 FOXL1Q12952 345 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 STRN3Q13033 797 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 DHCR24Q15392 516 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 BROXQ5VW32 411 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 SPRED1Q7Z699 444 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 SLC5A5Q92911 643 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 MYPNQ86TC9 1320 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 NEMP1O14524 444 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 MAFGO15525 162 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 GRM7Q14831 915 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 CLEC14AQ86T13 490 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 RABGGTAQ92696 567 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 GPHA2Q96T91 129 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 SOX7Q9BT81 388 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 IFT22Q9H7X7 185 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 MSL2Q9HCI7 577 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 USP18Q9UMW8 372 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 A0A1W2PRX2 142 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 MATN3O15232 486 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 RAB11FIP3O75154 756 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 TOX4O94842 621 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 PFKMP08237 780 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 MASP1P48740 699 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 ADAM8P78325 824 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 Q6ZSN1 163 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 TTC1Q99614 292 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 NELFAQ9H3P2 528 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 PRSS38A1L453 326 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 TNFRSF1AP19438 455 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 SOX5P35711 763 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 KRT40Q6A162 431 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 GAREM2Q75VX8 874 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 EDAQ92838 391 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 ANO3Q9BYT9 981 aa6.55□□□□□ -1.36
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