RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504849.5

RFC1-208, Transcript of replication factor C subunit 1, human

TSL 3

Gene RFC1, Length 873 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFC1-208	ENST00000504849	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	KY	Q8NBH2	561 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	SLC6A18	Q96N87	628 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	A2M	P01023	1474 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	SYNM	O15061	1565 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	UNC13B	O14795	1591 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	PLXNC1	O60486	1568 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	ATP10A	O60312	1499 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	NEMP1	O14524	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	MAFG	O15525	162 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	GSTM1	P09488	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	NAT1	P18440	290 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	CD53	P19397	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	PPP2CB	P62714	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	PPP2CA	P67775	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	POU4F1	Q01851	419 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	GBX1	Q14549	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	ZNF460	Q14592	562 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	NAT16	Q8N8M0	369 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	BVES	Q8NE79	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	TESK2	Q96S53	571 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFC1-208	ENST00000504849	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	ERC2	O15083	957 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	CLEC3A	O75596	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	PPM1B	O75688	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	CYP2C19	P33261	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	MRE11	P49959	708 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	KRT85	P78386	507 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	GRB10	Q13322	594 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	SCLY	Q96I15	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	WHRN	Q9P202	907 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	PTPRT	O14522	1441 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFC1-208	ENST00000504849	TBX3	O15119	743 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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