RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.49□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.49□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.49□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.49□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 MIEF2Q96C03 454 aa6.49□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.49□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 IL23AQ9NPF7 189 aa6.49□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.49□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 SLC25A3Q00325 362 aa6.48□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 DPTQ07507 201 aa6.48□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 CFAP100Q494V2 611 aa6.48□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 GAGE13Q4V321 117 aa6.48□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.48□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 ZNF627Q7L945 461 aa6.48□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.48□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.48□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 TCF25Q9BQ70 676 aa6.48□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 MYL10Q9BUA6 226 aa6.48□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.48□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.48□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 OXSMQ9NWU1 459 aa6.48□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 TMEM260Q9NX78 707 aa6.48□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 APOL3O95236 402 aa6.47□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 ADH4P08319 380 aa6.47□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.47□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 BCAR1P56945 870 aa6.47□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 ADCY2Q08462 1091 aa6.47□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 NME9Q86XW9 330 aa6.47□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.47□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 POFUT1Q9H488 388 aa6.47□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 MTG2Q9H4K7 406 aa6.47□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 ZMAT4Q9H898 229 aa6.47□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 TOMM22Q9NS69 142 aa6.47□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.47□□□□□ -1.37
SSB-211ENST00000490914 A0A0A6YYJ9 748 aa6.46□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 RFPL3O75679 317 aa6.46□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 MAKP20794 623 aa6.46□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 FLT3P36888 993 aa6.46□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 MAN2A2P49641 1150 aa6.46□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.46□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.46□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 KRT40Q6A162 431 aa6.46□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.46□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 C7orf31Q8N865 590 aa6.46□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 CEP89Q96ST8 783 aa6.46□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 SOX7Q9BT81 388 aa6.46□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.46□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 FAM83GA6ND36 823 aa6.45□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 OPHN1O60890 802 aa6.45□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 RABGGTBP53611 331 aa6.45□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 INHBEP58166 350 aa6.45□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 ADCY1Q08828 1119 aa6.45□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.45□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.45□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.45□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 NXPE1Q8N323 547 aa6.45□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 PGBD4Q96DM1 585 aa6.45□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 GPR87Q9BY21 358 aa6.45□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.45□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 NCDNQ9UBB6 729 aa6.45□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 KPNA6O60684 536 aa6.44□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 RPS6KA4O75676 772 aa6.44□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 STC2O76061 302 aa6.44□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 KIR2DL3P43628 341 aa6.44□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 INHBCP55103 352 aa6.44□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 Q6ZPA2 131 aa6.44□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 MB21D1Q8N884 522 aa6.44□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.44□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 PIF1Q9H611 641 aa6.44□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.44□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 XDHP47989 1333 aa6.44□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 A0A087X1B8 175 aa6.43□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 DAPK3O43293 454 aa6.43□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 FAM20BO75063 409 aa6.43□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 KRT4P19013 534 aa6.43□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 DSG1Q02413 1049 aa6.43□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.43□□□□□ -1.38
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