RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 SPG21Q9NZD8 308 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 DNM2P50570 870 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF410Q86VK4 478 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF169Q8NCN4 708 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 RSPH1Q8WYR4 309 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 S1PR5Q9H228 398 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 WDFY4Q6ZS81 3184 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM150BA6NC51 233 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 HIDE1A8MVS5 230 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 MAFO75444 373 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
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SH3BP4-210ENST00000489601 PSMC5P62195 406 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 ANKRD54Q6NXT1 300 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 KRT25Q7Z3Z0 450 aa18.63■□□□□ 0.57
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SH3BP4-210ENST00000489601 SLC39A11Q8N1S5 342 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 HELQQ8TDG4 1101 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 AIFM3Q96NN9 605 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
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SH3BP4-210ENST00000489601 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
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SH3BP4-210ENST00000489601 DDX11L8A8MPP1 907 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
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SH3BP4-210ENST00000489601 TECP42680 631 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 PHKA2P46019 1235 aa18.62■□□□□ 0.57
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SH3BP4-210ENST00000489601 STK3Q13188 491 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 INF2Q27J81 1249 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 SYCE2Q6PIF2 218 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 TRIM67Q6ZTA4 783 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 ANO5Q75V66 913 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 FBXL18Q96ME1 805 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 SH2D3AQ9BRG2 576 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 PDRG1Q9NUG6 133 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 CARNS1A5YM72 827 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC37A4O43826 429 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 SKIP12755 728 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 PPP2R5CQ13362 524 aa18.61■□□□□ 0.57
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SH3BP4-210ENST00000489601 PHF20Q9BVI0 1012 aa18.61■□□□□ 0.57
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SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM221A6NGB7 291 aa18.6■□□□□ 0.57
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SH3BP4-210ENST00000489601 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP18.6■□□□□ 0.57
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SH3BP4-210ENST00000489601 CYP26B1Q9NR63 512 aa18.6■□□□□ 0.57
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SH3BP4-210ENST00000489601 KCNJ14Q9UNX9 436 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 STK36Q9NRP7 1315 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa18.59■□□□□ 0.57
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SH3BP4-210ENST00000489601 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa18.59■□□□□ 0.57
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SH3BP4-210ENST00000489601 IFT122Q9HBG6 1241 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM105AQ9NUU6 356 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 PPME1Q9Y570 386 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-210ENST00000489601 TBX3O15119 743 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4-210ENST00000489601 XBP1P17861 261 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4-210ENST00000489601 SIGLEC14Q08ET2 396 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4-210ENST00000489601 TPRNQ4KMQ1 711 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4-210ENST00000489601 PLA2G4FQ68DD2 849 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4-210ENST00000489601 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.58■□□□□ 0.56
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