RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 PTPAQ15257 358 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 PADI6Q6TGC4 694 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 RNF149Q8NC42 400 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 BHMT2Q9H2M3 363 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 E9PMD0 336 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 CYP11B2P19099 503 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 GLRA2P23416 452 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 HYIQ5T013 277 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 MCPH1Q8NEM0 835 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 PNMA5Q96PV4 448 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 C17orf80Q9BSJ5 609 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 GPRC5CQ9NQ84 441 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 CHST12Q9NRB3 414 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 EYA4O95677 639 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 GATMP50440 423 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 PTENP60484 403 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 GRIN1Q05586 938 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 POU5F1BQ06416 359 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 CAPSQ13938 189 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 KCNK18Q7Z418 384 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 FIBCD1Q8N539 461 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 DNM3Q9UQ16 869 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 COL4A6Q14031 1691 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 LINC00271P0C7V0 271 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 GRB10Q13322 594 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 TFDP1Q14186 410 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 AK8Q96MA6 479 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 A0A0U1RQF3 1178 aa23.25■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 LPXNO60711 386 aa23.25■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 PHKA2P46019 1235 aa23.25■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.25■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 DACT1Q9NYF0 836 aa23.25■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 IGFBP4P22692 258 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 LONP1P36776 959 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 TMEM119Q4V9L6 283 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 CABP7Q86V35 215 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 TMEM192Q8IY95 271 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 SAMD11Q96NU1 681 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 USP28Q96RU2 1077 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 PLIN2Q99541 437 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 EPC2Q52LR7 807 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 BSNDQ8WZ55 320 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 POLD4Q9HCU8 107 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 RNF19AQ9NV58 838 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 SLC26A4O43511 780 aa23.22■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 FGFR1P11362 822 aa23.22■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.313e-26■■■□□ 17.4
ACTB-211ENST00000480301 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.22■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.22■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.22■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms