RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 SPRED2Q7Z698 418 aa18.32■□□□□ 0.52
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ATG4B-216ENST00000475195 SAMD11Q96NU1 681 aa18.32■□□□□ 0.52
ATG4B-216ENST00000475195 NFKBIZQ9BYH8 718 aa18.32■□□□□ 0.52
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ATG4B-216ENST00000475195 SLC26A4O43511 780 aa18.31■□□□□ 0.52
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ATG4B-216ENST00000475195 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa18.29■□□□□ 0.52
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ATG4B-216ENST00000475195 SLC39A14Q15043 492 aa18.27■□□□□ 0.52
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ATG4B-216ENST00000475195 FAM102BQ5T8I3 360 aa18.27■□□□□ 0.52
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM192Q8IY95 271 aa18.27■□□□□ 0.52
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ATG4B-216ENST00000475195 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
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ATG4B-216ENST00000475195 C1orf186Q6ZWK4 172 aa18.26■□□□□ 0.51
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ATG4B-216ENST00000475195 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 CABP7Q86V35 215 aa18.26■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 USP28Q96RU2 1077 aa18.26■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 RNF19AQ9NV58 838 aa18.26■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa18.26■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 EYSQ5T1H1 3165 aa18.26■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 HOXA2O43364 376 aa18.25■□□□□ 0.51
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