RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474246.1

SMARCE1-208, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCE1, Length 2,124 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-208ENST00000474246 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 CCPG1Q9ULG6 757 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 AK5Q9Y6K8 562 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 M0R3H8 397 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 GFRA3O60609 400 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 TBC1D8O95759 1140 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 DDX58O95786 925 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 PSMC4P43686 418 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 CCT8P50990 548 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 AP1B1Q10567 949 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 KIF5AQ12840 1032 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 RASGRF1Q13972 1273 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 SCARB2Q14108 478 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 SSPNQ14714 243 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 GRM3Q14832 879 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 PPA1Q15181 289 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 PERM1Q5SV97 790 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 MDM1Q8TC05 714 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 CITED4Q96RK1 184 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 MYD88Q99836 296 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 FSD1Q9BTV5 496 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 ABCB6Q9NP58 842 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 EYA2O00167 538 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 FRS3O43559 492 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 CEP104O60308 925 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 S1PR4O95977 384 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 CHRNA5P30532 468 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 GRK6P43250 576 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 IL1RL1Q01638 556 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 GBE1Q04446 702 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 AP3B2Q13367 1082 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 LIN54Q6MZP7 749 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 ESX1Q8N693 406 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 MROH8Q9H579 483 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 EDARQ9UNE0 448 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 CRYL1Q9Y2S2 319 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-208ENST00000474246 CSPG5O95196 566 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 HSPA4LO95757 839 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 CPP00450 1065 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 AKR1B1P15121 316 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 ATP5OP48047 213 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 ETV1P50549 477 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 CD83Q01151 205 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 NR1H3Q13133 447 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 TUBA3CQ13748 450 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 NCOA4Q13772 614 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 CCDC183Q5T5S1 534 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 ATG9AQ7Z3C6 839 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 MYLIPQ8WY64 445 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 SHC3Q92529 594 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.65□□□□□ -1.35
SMARCE1-208ENST00000474246 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6.65□□□□□ -1.35
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