RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472880.1

COL9A3-210, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 959 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-210ENST00000472880 TCF25Q9BQ70 676 aa22.18■■□□□ 1.14
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COL9A3-210ENST00000472880 EOMESO95936 686 aa22.17■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 PBX3P40426 434 aa22.17■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 KRT17Q04695 432 aa22.17■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 ZNF410Q86VK4 478 aa22.17■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.17■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 HELQQ8TDG4 1101 aa22.17■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 FAM20AQ96MK3 541 aa22.17■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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COL9A3-210ENST00000472880 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.17■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 PFKFB2O60825 505 aa22.16■■□□□ 1.14
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COL9A3-210ENST00000472880 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.16■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.16■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 ANO5Q75V66 913 aa22.16■■□□□ 1.14
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COL9A3-210ENST00000472880 RNF135Q8IUD6 432 aa22.16■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.16■■□□□ 1.14
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COL9A3-210ENST00000472880 CHST12Q9NRB3 414 aa22.16■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.16■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 SPG21Q9NZD8 308 aa22.16■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 VAV3Q9UKW4 847 aa22.16■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.16■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 EML1O00423 815 aa22.15■■□□□ 1.14
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COL9A3-210ENST00000472880 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.15■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.15■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 NLRP4Q96MN2 994 aa22.15■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.15■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 PHKA2P46019 1235 aa22.14■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 ANKRD1Q15327 319 aa22.14■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 TMC7Q7Z402 723 aa22.14■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.14■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.14■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 WASF1Q92558 559 aa22.14■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 TBX3O15119 743 aa22.13■■□□□ 1.13
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COL9A3-210ENST00000472880 SKIP12755 728 aa22.13■■□□□ 1.13
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COL9A3-210ENST00000472880 ANAPC15P60006 121 aa22.13■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.13■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.13■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 OXER1Q8TDS5 423 aa22.13■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.13■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.13■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 C5orf42Q9H799 3197 aa22.13■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 HIDE1A8MVS5 230 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 TECP42680 631 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 RAB27AP51159 221 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 NPEPPSP55786 919 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 POTEDQ86YR6 584 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 KSR1Q8IVT5 923 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 CEP170P1Q96L14 293 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 PPME1Q9Y570 386 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 DTNBO60941 627 aa22.11■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 CA8P35219 290 aa22.11■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 AK2P54819 239 aa22.11■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 BCAR1P56945 870 aa22.11■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.11■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.11■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.11■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.11■■□□□ 1.13
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COL9A3-210ENST00000472880 TMEM169Q96HH4 297 aa22.11■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 LXNQ9BS40 222 aa22.11■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.11■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.132e-12■■■□□ 14.9
COL9A3-210ENST00000472880 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 CTDNEP1O95476 244 aa22.1■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 KRT2P35908 639 aa22.1■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 RFC5P40937 340 aa22.1■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 KCNC3Q14003 757 aa22.1■■□□□ 1.13
COL9A3-210ENST00000472880 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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