RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 PRR35P0CG20 571 aa2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 ADCY1Q08828 1119 aa2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 SPIRE1Q08AE8 756 aa2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 PRSS53Q2L4Q9 553 aa2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 GAGE13Q4V321 117 aa2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 SLC9A4Q6AI14 798 aa2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 KLHDC10Q6PID8 442 aa2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 MARK4Q96L34 752 aa2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 ASB6Q9NWX5 421 aa2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 FLRT1Q9NZU1 646 aa2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 RCAN3Q9UKA8 241 aa2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 PROCRQ9UNN8 238 aa2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 C2orf78A6NCI8 922 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 PRSS47A8MTI9 375 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 PRSS44E7EML9 344 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 WNT9AO14904 365 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 MC4RP32245 332 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 ECE1P42892 770 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 TCIRG1Q13488 830 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 DENND5AQ6IQ26 1287 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 TMC4Q7Z404 712 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 WDR48Q8TAF3 677 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 BTN2A2Q8WVV5 523 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 ARL8AQ96BM9 186 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 ADAM2Q99965 735 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 NDC1Q9BTX1 674 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 AMNQ9BXJ7 453 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 HAPLN2Q9GZV7 340 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 OR10A5Q9H207 317 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 CHST2Q9Y4C5 530 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 SPDEFO95238 335 aa2.59□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 CPP00450 1065 aa2.59□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 PRKCGP05129 697 aa2.59□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 GNAT1P11488 350 aa2.59□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 BMT2Q1RMZ1 405 aa2.59□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 BTBD8Q5XKL5 378 aa2.59□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 FBXW10Q5XX13 1052 aa2.59□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 LRSAM1Q6UWE0 723 aa2.59□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 FAM161BQ96MY7 647 aa2.59□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 LGR4Q9BXB1 951 aa2.59□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 BHMT2Q9H2M3 363 aa2.59□□□□□ -1.99
SHQ1-204ENST00000468347 MPIG6BO95866 241 aa2.58□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 ITGAMP11215 1152 aa2.58□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP2.58□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 AOAHP28039 575 aa2.58□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 METTL24Q5JXM2 366 aa2.58□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 PLXDC1Q8IUK5 500 aa2.58□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa2.58□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 PDLIM2Q96JY6 352 aa2.58□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 APBA2Q99767 749 aa2.58□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 CD244Q9BZW8 370 aa2.58□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 BTBD7Q9P203 1132 aa2.58□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 FAM90A27PA6NNH2 459 aa2.57□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 STC2O76061 302 aa2.57□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 KELP23276 732 aa2.57□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP10-8P60410 259 aa2.57□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 LAMB3Q13751 1172 aa2.57□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 DDB1Q16531 1140 aa2.57□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 DENND1AQ8TEH3 1009 aa2.57□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 IL17RBQ9NRM6 502 aa2.57□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 PPEF2O14830 753 aa2.56□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 FDXRP22570 491 aa2.56□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 LINC00205P59089 165 aa2.56□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 SPIDRQ14159 915 aa2.56□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 SF1Q15637 639 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 AKNAD1Q5T1N1 836 aa2.56□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 MORN5Q5VZ52 161 aa2.56□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 Q6ZNX1 250 aa2.56□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 TMPRSS12Q86WS5 348 aa2.56□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 ACRBPQ8NEB7 543 aa2.56□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 UROC1Q96N76 676 aa2.56□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 RIC8BQ9NVN3 520 aa2.56□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 B4E1Z4 1266 aa2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 TBX1O43435 398 aa2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 MSCO60682 206 aa2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 VSIG10L2P0DP72 767 aa2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP10-3P60369 221 aa2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 KIAA1211LQ6NV74 962 aa2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC82Q8N4S0 544 aa2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 OR52N2Q8NGI0 321 aa2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 SH3RF2Q8TEC5 729 aa2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 NR4A3Q92570 626 aa2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 PPP1R14AQ96A00 147 aa2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms