RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKRD53Q8N9V6 530 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 WDR92Q96MX6 357 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 GPHA2Q96T91 129 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 SOX7Q9BT81 388 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 EMC7Q9NPA0 242 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 VWA7Q9Y334 891 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A0A6YYJ9 748 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 OPHN1O60890 802 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 LSSP48449 732 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 TCIRG1Q13488 830 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 GRM7Q14831 915 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 TERF2Q15554 542 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 SDE2Q6IQ49 451 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 POLNQ7Z5Q5 900 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 RNF180Q86T96 592 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 THNSL2Q86YJ6 484 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 PASD1Q8IV76 773 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 MYPNQ86TC9 1320 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 PRSS38A1L453 326 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 PLSCR1O15162 318 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 CLEC2LP0C7M8 214 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 HS1BP3Q53T59 392 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 BROXQ5VW32 411 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 CLEC14AQ86T13 490 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 RABGGTAQ92696 567 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 ANO3Q9BYT9 981 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 PRDM12Q9H4Q4 367 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 USP18Q9UMW8 372 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A1W2PRX2 142 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 NEMP1O14524 444 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 TOX4O94842 621 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 STRN3Q13033 797 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 DDB1Q16531 1140 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 GAREM2Q75VX8 874 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 PLA2G15Q8NCC3 412 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 EXTL1Q92935 676 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 FERMT2Q96AC1 680 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC6A15Q9H2J7 730 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 TLR9Q9NR96 1032 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 MAPRE3Q9UPY8 281 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-206ENST00000467748 GOLGA8BA8MQT2 603 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 IGSF3O75054 1194 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 AMHP03971 560 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 BPIP17213 487 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 LSP1P33241 339 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 PHC1P78364 1004 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR158Q5T848 1215 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 D2HGDHQ8N465 521 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 PIK3C3Q8NEB9 887 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 EDAQ92838 391 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC5A5Q92911 643 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 NELFAQ9H3P2 528 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 TESMINQ9Y4I5 508 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 UBE2QL1A1L167 161 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 KDM1AO60341 852 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 PFKMP08237 780 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 HSD3B2P26439 372 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 ZXDAP98168 799 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 OCRLQ01968 901 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 CD69Q07108 199 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 PDCD1Q15116 288 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 C11orf74Q86VG3 221 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 SGMS1Q86VZ5 419 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 LYSMD2Q8IV50 215 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 Q8N1X5 172 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 USP7Q93009 1102 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 LPPQ93052 612 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 HIST1H2AJQ99878 128 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF747Q9BV97 191 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 ING3Q9NXR8 418 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 NCDNQ9UBB6 729 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-206ENST00000467748 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms