RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 SYT1P21579 422 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 TFDP1Q14186 410 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 DSC3Q14574 896 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 CATSPER4Q7RTX7 472 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 MCPH1Q8NEM0 835 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 DACT1Q9NYF0 836 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 RWDD3Q9Y3V2 267 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A087WWV3 80 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 FGFR4P22455 802 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 PHKA2P46019 1235 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ADGRE1Q14246 886 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 CRIPAKQ8N1N5 446 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF149Q8NC42 400 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 C17orf80Q9BSJ5 609 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 IFT122Q9HBG6 1241 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 CHST12Q9NRB3 414 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM161AQ9NX61 479 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 VWA3AA6NCI4 1184 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 EPOPA6NHQ4 379 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 RFXAPO00287 272 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 HOXA2O43364 376 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SPRED2Q7Z698 418 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM192Q8IY95 271 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 KIAA1024Q9UPX6 916 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 STX6O43752 255 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ARL2P36404 184 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM189BP81408 668 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 POU5F1BQ06416 359 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 GRB10Q13322 594 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 IL17AQ16552 155 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 EPC2Q52LR7 807 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PADI6Q6TGC4 694 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 GDPD5Q8WTR4 605 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 DNM3Q9UQ16 869 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A0U1RQF3 1178 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PP2D1A8MPX8 630 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ERLIN2O94905 339 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SKIP12755 728 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 CTNNB1P35222 781 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PTENP60484 403 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 RESTQ13127 1097 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ECM1Q16610 540 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM102BQ5T8I3 360 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 MAEAQ7L5Y9 396 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ECHDC2Q86YB7 292 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ABI1Q8IZP0 508 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 MICALL1Q8N3F8 863 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 KCTD17Q8N5Z5 321 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ASAP3Q8TDY4 903 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 AK8Q96MA6 479 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 NT5C3AQ9H0P0 336 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 BHMT2Q9H2M3 363 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 LMCD1Q9NZU5 365 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 MYO7AQ13402 2215 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 EYA4O95677 639 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 EOMESO95936 686 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 RB1P06400 928 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 CYP11B2P19099 503 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 GLRA2P23416 452 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 CDC25AP30304 524 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 RAB27AP51159 221 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 CAPSQ13938 189 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF169Q8NCN4 708 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PPM1EQ8WY54 764 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAIPQ9BWF2 469 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PLVAPQ9BX97 442 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 NFKBIZQ9BYH8 718 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 MTMR6Q9Y217 621 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 MTCH2Q9Y6C9 303 aa16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms