RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462384.6

TMX4-202, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene TMX4, Length 873 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4-202ENST00000462384 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.02■■□□□ 1.28
TMX4-202ENST00000462384 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
TMX4-202ENST00000462384 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
TMX4-202ENST00000462384 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
TMX4-202ENST00000462384 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.02■■□□□ 1.28
TMX4-202ENST00000462384 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 KCNA5P22460 613 aa23.01■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 CDC42EP1Q00587 391 aa23.01■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 SPPL3Q8TCT6 385 aa23.01■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 CASD1Q96PB1 797 aa23.01■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.01■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 NBR1Q14596 966 aa23■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 CLLU1OSQ5K130 101 aa23■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 EP400NLQ6ZTU2 488 aa23■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 TMEM117Q9H0C3 514 aa23■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 CWH43Q9H720 699 aa23■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 PPME1Q9Y570 386 aa23■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 VCANP13611 3396 aa23■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 A0A0U1RQF3 1178 aa22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 TNFRSF10AO00220 468 aa22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 ST18O60284 1047 aa22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 IRS1P35568 1242 aa22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 TTC38Q5R3I4 469 aa22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 NEK9Q8TD19 979 aa22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 MTRQ99707 1265 aa22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 DACT1Q9NYF0 836 aa22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 LYPLA2O95372 231 aa22.98■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 TECP42680 631 aa22.98■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 HYAL1Q12794 435 aa22.98■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 LONRF3Q496Y0 759 aa22.98■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 FERMT3Q86UX7 667 aa22.98■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 POF1BQ8WVV4 589 aa22.98■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.98■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.98■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 HOXA2O43364 376 aa22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 OR52Z1P0C646 297 aa22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 ABI1Q8IZP0 508 aa22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 RNF149Q8NC42 400 aa22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 HELQQ8TDG4 1101 aa22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 TCP11Q8WWU5 503 aa22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 LPPQ93052 612 aa22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 TMX3Q96JJ7 454 aa22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 CHST12Q9NRB3 414 aa22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 AAASQ9NRG9 546 aa22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 CLDND1Q9NY35 253 aa22.97■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 MED24O75448 989 aa22.96■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 PBX3P40426 434 aa22.96■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 PHKA2P46019 1235 aa22.96■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 RARRES1P49788 294 aa22.96■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 LRRC43Q8N309 656 aa22.96■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 IGFLR1Q9H665 355 aa22.96■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 TTC28Q96AY4 2481 aa22.96■■□□□ 1.27
TMX4-202ENST00000462384 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.95■■□□□ 1.26
TMX4-202ENST00000462384 LINC01565O15544 149 aa22.95■■□□□ 1.26
TMX4-202ENST00000462384 FGF18O76093 207 aa22.95■■□□□ 1.26
TMX4-202ENST00000462384 LAG3P18627 525 aa22.95■■□□□ 1.26
TMX4-202ENST00000462384 COL19A1Q14993 1142 aa22.95■■□□□ 1.26
TMX4-202ENST00000462384 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.95■■□□□ 1.26
TMX4-202ENST00000462384 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.95■■□□□ 1.26
TMX4-202ENST00000462384 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.95■■□□□ 1.26
TMX4-202ENST00000462384 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TMX4-202ENST00000462384 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.95■■□□□ 1.26
TMX4-202ENST00000462384 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.95■■□□□ 1.26
TMX4-202ENST00000462384 EOMESO95936 686 aa22.94■■□□□ 1.26
TMX4-202ENST00000462384 IL9P15248 144 aa22.94■■□□□ 1.26
TMX4-202ENST00000462384 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
TMX4-202ENST00000462384 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TMX4-202ENST00000462384 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.94■■□□□ 1.26
TMX4-202ENST00000462384 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms