RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 DEFB123Q8N688 67 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 DRC1Q96MC2 740 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 FAM161BQ96MY7 647 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 USP28Q96RU2 1077 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 CSRNP2Q9H175 543 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 C2orf40Q9H1Z8 148 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 ADAMTS10Q9H324 1103 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 ZHX3Q9H4I2 956 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 FAM13BQ9NYF5 915 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 E9PMD0 336 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 YEATS4O95619 227 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 PLA2G4BP0C869 781 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 STAT6P42226 847 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 DEFB103AP81534 67 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 GPNMBQ14956 572 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 TPRNQ4KMQ1 711 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 SPECC1Q5M775 1068 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 RASIP1Q5U651 963 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 SPATA32Q96LK8 384 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 TIPINQ9BVW5 301 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 PBX4Q9BYU1 374 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 ERVK-5Q9HDB9 667 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 CHST12Q9NRB3 414 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 TET1Q8NFU7 2136 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 HOXA2O43364 376 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 CUTAO60888 179 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 PPP6R2O75170 966 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 TBCAO75347 108 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 FAM13AO94988 1023 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 GJB5O95377 273 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 FGFR4P22455 802 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 ARL2P36404 184 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 PBX2P40425 430 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 NASPP49321 788 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 SARSP49591 514 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 KARSQ15046 597 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 MAPK6Q16659 721 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 SV2BQ7L1I2 683 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 FAM228AQ86W67 206 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 NPAS4Q8IUM7 802 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 FIBCD1Q8N539 461 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 LINC01465Q8N7H1 131 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 TOP1MTQ969P6 601 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 PGBD4Q96DM1 585 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 CLIC6Q96NY7 704 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 PANK2Q9BZ23 570 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 CCSER1Q9C0I3 900 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 LRRC27Q9C0I9 530 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 ZNF576Q9H609 170 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 KMT5AQ9NQR1 393 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 KCND2Q9NZV8 630 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa10.58□□□□□ -0.71
PKP4-208ENST00000462335 TMEM265A0A087WTH1 108 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 H0YCG3 227 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 K7ERI5 159 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 CA3P07451 260 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 MYOGP15173 224 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 PLCG1P19174 1290 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 DDIT3P35638 169 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP10.58□□□□□ -0.721e-6■■■■□ 23.3
PKP4-208ENST00000462335 EFNA5P52803 228 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 PEX3P56589 373 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 AMPD3Q01432 767 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 POU5F1BQ06416 359 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 STRN3Q13033 797 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 PTPAQ15257 358 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 ECM1Q16610 540 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 NOTUMQ6P988 496 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 GPBP1Q86WP2 473 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 LINC00301Q8NCQ3 95 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 TMEM40Q8WWA1 233 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 CCDC34Q96HJ3 373 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 EPSTI1Q96J88 318 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 CEP89Q96ST8 783 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 ADPGKQ9BRR6 497 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 SEMA6BQ9H3T3 888 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 GPRC5CQ9NQ84 441 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-208ENST00000462335 AAASQ9NRG9 546 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms